一般情况下，小孩支原体感染可以采用以下方式进行治疗：
小孩支原体感染后会发生呼吸道的炎症，例如支原体肺炎，此时需要对症及抗支原体的药物进行处理。对于持续的刺激性咳嗽，可以使用糜奈德雾化液进行治疗，能够减轻咳嗽。可以口服复方氨溴特罗、福尔可定口服液等止咳类的药物进行治疗。平时做好自身防护工作，尽量不要去人多的场所，以免发生交叉感染。
支原体是最小的、能够独立生活的原核生物，它不同于细菌，也不同于病毒，但是它有某些细菌的特性，支原体只有细胞膜的结构，没有细胞壁，通过破坏细胞壁杀死细菌的抗生素对支原体是无效的。
支原体感染可以通过药物治疗来进行改善。
支原体的感染可以通过服用阿奇霉素等口服的药物来缓解症状，同时还可以针对症状进行相应的处理。支原体感染会导致支气管炎和肺炎，会导致咳嗽咳痰，可以服用一些具有镇咳化痰作用的药物，同时还可以服用一些退烧药。
病人在做检查时候发现支原体类感染，不一定需要治疗，因为支原体在女性生殖道检出率非常高，妊娠合并支原体如果没有临床症状，可以不治疗。
人型支原体、解脲支原体、生殖支原体是常见的与泌尿生殖道感染有关的三种支原体。只是解脲支原体检测出阳性，无其他异常，不会影响妊娠过程或结局。相对影响较大的通常是生殖支原体，要查出来需要做培养，生殖支原体一般衣原体、淋球菌，等其他病原体合并感染时才致病，如下腹疼痛、阴道分泌物增多等，单独生殖支原体也并不致病。如同时检测到上述微生物，要根据药敏结果或培养及时进行合理治疗，单独检测到则不必过于担心。
解脲支原体感染通常可以通过用药、护理等方式治疗。
如果是解脲支原体感染，可以遵医嘱使用强力霉素、美满霉素、阿奇霉素等药物，通常建议在进行药敏试验后再确定药物类型。治疗过程中要注意休息，不要喝浓茶、喝咖啡，不要吃辛辣的东西。
患者要定期复查，治疗期间禁止同房，要对被污染的衣服要进行清洗和消毒。
男性有支原体感染主要是通过药物进行治疗。
对于支原体感染，临床属于性病的一种，具有一定的传染性。男性有支原体感染，一般需要在医生指导下使用药物进行治疗，常见的药物有阿奇霉素片、四环素片、罗红霉素片等，能够抑制微生物生长，缓解感染的现象。
同时，在此期间需注意避免进行性生活，防止出现交叉感染。