一般情况下，小孩使用激素副作用首先可能是容易导致小孩的性发育提早，导致骨骼过早的关闭，导致儿童的一生高过短。其次会影响小孩内分泌，引起体内激素分泌失调，增加小孩肥胖的几率。还可能降低小孩骨骼的密度，增加患骨质疏松症的危险，小孩在激烈的运动后很有机会出现骨折。还可能对小孩的肝脏和肾脏有一定的损害，会导致小孩的抵抗力降低。
激素对人体的生长、发育、繁殖、代谢等许多生理机能具有很重要的作用，一旦失衡，就会造成各类疾病，所有激素处于一个平衡的状态，无论是多还是少都会给机体带来副作用。如果男性身体内雌激素过多，会出现乳腺增生、乳房发育等女性特征。
生长激素可以促进人类骨骼，内脏和全身的生长发育，还可以促进蛋白质的合成，影响身体内多种代谢，例如脂肪代谢，矿物质代谢等，在人的生长发育当中起着关键作用。可能会导致孩子患上巨人症，出现头痛，恶心，呕吐的症状，并且还会打乱人身体内激素的平衡，造成内分泌紊乱现象。
小孩发育迟缓可以使用生长激素，现在治疗孩子矮身材有一个办法就是用生长激素，对于各种原因引起的身材矮小都有效果（其先决条件是骨骺尚未充分闭合），并且由于它与人体天然的生长激素结构完全相同，因此比较稳妥，但生长激素的治疗中也有副作用，如轻度水钠短暂滞留。
此外，小孩发育迟缓应该注意保持营养合理，可以促进发育。
激素可能会加重骨质疏松，会造成胃溃疡、消化性溃疡，也可能会造成高血压难以控制，甚至会诱导糖尿病的发生，继发糖尿病是因为长期吃激素造成的，因为内分泌疾病，因为类风湿需要长期吃激素。