月经第几天查激素六项要看具体情况。
女性在来例假后2~3日空腹做一次血检，主要看有无多囊卵巢综合征、卵巢功能下降等。要确定是否有排卵，首先要做好女性体内的雌性激素和黄体生成素的含量，最好是在排卵后的14-16日进行检测。要判断女性的黄体功能，最好是在来月经的前一天进行检查，也就是来月经的二十三四天。
来月经的第2-5天之间，空腹抽血化验激素六项是比较准确的，女性出现月经持续时间长或者来月经之前有阴道出血现象，可能是黄体功能异常引起的，需要在来月经之前1周抽血化验激素六项。
月经第2天是可以去查性激素六项的。因为性激素六项，一般是检查患者在基础的技术水平应该是在月经来潮时就进行检查的。性激素六项包括卵泡生成素、黄体生成素、睾酮、孕酮雌二醇和催乳素。
查激素六项准确度最高，在月经来后的第2天至第5天之内，而最佳时间是来例假后的第3天，这时候被称为卵巢发育的卵泡期，检查的结果是最准确的。检查前不需要空腹，在检查前一个月内不能使用任何激素类药物，以免影响检查结果的准确性。
做激素6项检查在月经来潮的第2-5天，因为在月经周期不同的时间段，比如卵泡期、排卵期、黄体期，激素含量是不一样的。在月经来潮以后第2-5天，无论是否有月经紊乱，均处于卵泡期，这一个时间段激素含量比较稳定，抽血化验可以估计内分泌大体上情况。如果判断是否有排卵，应该在月经来潮以前的一周检查，如果孕激素升高，就可以表明排卵了。
在月经来后的第2天至第5天准确度最高，而最佳时间是来例假后的第3天，这时候被称为卵巢发育的卵泡期，检查的结果是最准确的，检验的是生殖激素的基础水平；月经第14-16天取血，检验的是排卵期的生殖激素水平，也是评价生育能力的重要指标。