一般来说，对于右侧卵巢囊肿直径小于5cm，且患者没有任何不舒服的表现，对于这种情况可以考虑月经干净之后复查妇科彩超。对于右侧卵巢囊肿直径大于5cm，且复查妇科彩超持续存在，或患者合并有急性的下腹痛等，则建议患者前往医院就诊，在医生的指导下通过患侧附件切除术，患侧卵巢囊肿剥除术等方式进行治疗。
此外，患者应该注意局部卫生，同时注意适当运动，有助于改善症状。
右侧卵巢囊肿的治疗方法有药物保守治疗和手术治疗，具体选择哪种治疗方法需要结合囊肿的性质，大小与血运等多因素综合分析判断选择的。可以服用活血化瘀的中成药来进行治疗。
一般情况下，如果早孕期发现右侧卵巢囊肿，需要根据孕妇的具体情况来选择治疗方案。
在早孕期发现右侧卵巢囊肿后，如果卵巢囊肿不再持续的增大，也没有其他任何的异常症状，可以每两个月去医院做子宫和卵巢的B超检查，观察胎儿生长情况以及卵巢囊肿的生长情况，如果不再持续增大，先不用进行处理，将胎儿顺利生下后再进行治疗；如果卵巢囊肿持续增大，建议终止妊娠，然后再通过药物、手术等方式进行治疗，以免给身体造成不可逆的伤害。
女性在孕期出现的右侧卵巢囊肿，如果囊肿的体积不超过4cm，就是生理性囊肿，因为妊娠后雌激素和孕激素的水平出现了变化，所以出现了黄体囊肿或黄素化囊肿。
如果是在妊娠之前就有，但是怀孕后生长速度加快，囊肿体积增大，那么就有可能是病理性的囊肿，这种情况下要根据B超判断囊肿的性质，5cm以上的良性和恶性囊肿都要做手术。
孕妇体内的雌激素和孕激素水平会改变，从而导致生理性的卵巢囊肿，在妊娠前没有，在妊娠后会出现，多半是生理性的卵巢囊肿。
正常情况下，只要不超过3cm，就不需要做特别的处理，因为右侧卵巢囊肿会自动消失，所以要定期做B超检查，以了解囊肿的发育；如果右侧囊肿大于5cm，那么卵巢囊肿有可能会对子宫造成挤压，从而影响到胎儿的生长。
孕检发现，需要观察到孕12周，看囊肿大小有无变化。怀孕之后可以合并黄体囊肿，而黄体囊肿会随着妊娠周数的增大自行缩小甚至消失。孕12周可以根据囊肿的大小、性质、部位、孕妈及家属的意见来决定。对于直径大于8厘米的囊肿，在孕16-20周，采用手术治疗。
