由于卵巢囊肿的具体性质不同，所以其原因也会有很大差异。
卵巢上有黄体囊肿，可能是因为排卵后LH激素的刺激，导致了生理囊肿。如果是卵巢上的普通囊肿，可能是因为体内的雌激素水平太高所致。卵巢上有炎性囊肿，可能是因为附件炎。如果是卵巢上的巧克力囊肿，可能是因为子宫内膜异位到了卵巢上，主要是因为盆腔手术，或是经期有性生活。
怀孕会卵巢囊肿的原因如下：
女性患者在怀孕以后，卵巢需要形成黄体，黄体的分泌的激素，才能够支撑正常的怀孕，继续延伸下去。在这情况下，卵巢的黄体继续增大，就会在B超下显示，卵巢比没有怀孕时要大，因此，孕妇对于这个问题不必过度紧张担忧。如果囊肿存在异常，就需要及时去正规医院进行检查治疗，防止出现不必要的意外。另外，孕妈在孕期需要定期去正规医院进行产检，观察胎儿的发育状况，排除胎儿的异常情况。
卵巢囊肿有可能会引起长斑的。卵巢囊肿有可能是内分泌失调、生活不规律、压力过大等原因引起的，这些因素在引起卵巢囊肿的同时，也可能会引起皮肤长斑。卵巢囊肿病人要及时到医院做详细检查，尽早治疗，调理好内分泌。平时注意休息，不要熬夜以及过于劳累，多吃些富含维生素C的食物，适当的参加体育锻炼。
卵巢囊肿发病的原因可能和其他的慢性疾病一样，是遗传因素与环境因素相互作用的结果，也可能与内分泌紊乱、饮食结构失衡等因素有关。如果在常规的检查中发现卵巢囊肿，患者要去医院做激素六项水平检测，如果激素紊乱就要进行调理。如果没有这种情况，也要注意从饮食习惯、运动锻炼等方面进行调理，或许对减少这种疾病的发生有一些效果。
右侧卵巢囊肿属于常见的妇科疾病，引起卵巢囊肿的原因主要是一下三个方面：
1、如果长期生活习惯不良，平时生活压力过大，导致精神高度紧张，可能会引起右侧卵巢囊肿。
2、如果经常吃含有激素成分比较高的蔬菜和食物，如大豆及各种豆制品，还有延缓衰老的滋补品，可能会增加右侧卵巢囊肿的几率。
3、如果患有内分泌失调，造成体内激素水平紊乱，可能也会引起右侧卵巢囊肿。
右侧卵巢囊肿需要及时到医院进行检查，根据检查结果对症治疗。
一般来说，患有卵巢囊肿要做肿瘤标志物检查，主要是因为卵巢囊肿大部分属于妇科良性肿瘤，但是还要排除有恶性程度的可能性，所以通常最好做肿瘤标志物的化验检查。此外，如果患者是卵巢囊肿，同时伴有痛经的症状，通过肿瘤标志物检查，如果检查发现CA125出现轻度升高，就高度怀疑是否由于子宫内膜异位症引起的囊肿，通常可为临床上下一步的治疗提供可靠依据。