一般情况下，来月经时肚子疼，应根据肚子疼的具体位置及伴随症状选择药物。
女性在小腹部右侧会有剧烈的疼痛感，并且伴有恶心、呕吐等现象。若为小肚子正中痛，以及腰骶部痛，常被认为有痛经症状者，可给予双氯芬酸钠、元胡止痛片止痛；若为小肚子左侧痛，并有明显腹泻者，则被认为肠炎所致，可给予蒙脱石散、黄连素等药物。
来月经肚子疼、腰疼，可能是痛经、胃炎、宫颈炎等原因引起的。如果是痛经引起的可以吃布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片、妇科千金片等进行治疗，如果是胃炎引起的，可以使用奥美拉唑肠溶片、铝碳酸镁咀嚼片、雷贝拉唑钠肠溶片等药物进行治疗。如果是宫颈炎引起的，可以使用注射用头孢唑肟钠、阿奇霉素胶囊、注射用盐酸大观霉素等药物进行治疗。
一般情况下，经期肚子疼，大部分女性都可以通过服用前列腺素合成酶抑制剂、中成药来缓解痛经。
可以服用元胡止痛片，布洛芬缓释胶囊进行缓解，这种情况多数是属于原发性的痛经。也有可能是属于气滞血郁，宫颈口狭窄，经血不能够通畅的排出体外，可以局部进行热敷，多喝一些姜糖水或者是茉莉花茶，建议在来月经就开始服用，效果会更好。
后天某些因素造成，如一些妇科疾病，子宫肌瘤，子宫腺肌症，子宫内膜异位症，或者是因为流产，引产，正常生产后没有修养好，留下的后遗症。或者是因为平时一些因素导致的内分泌受到影响，这都是有可能的。及时到医院检查一下子宫超声，化验一下激素水平，对症治疗。
考虑是经期综合征痛经，对于痛经可以在月经来潮一个星期口服颗粒，经期注意腹部的保暖月经期注意腹部的保暖，避免劳累和重体力劳动，月经期忌食，生冷辛辣的食物刺激，月经量多，可以口服宫药物止血。
月经期肚子疼尽量吃一些营养丰富并且比较清淡的食物，可以多吃鸡蛋、瘦肉，能够增加体内的高蛋白，还可以多吃一些铁含量高的食物，比如菠菜、猪肝等。每次来月经都会肚子不舒服，是属于典型的痛经症状，痛经分为原发性痛经和继发性痛经。大多数病人都是属于原发性的痛经，但也有少数是属于继发性痛经。