一般情况下，如果到了妇科检查的时候就提示卵巢囊肿的存在，这就需要在第2个月的时候复查。
如果囊肿较小，一般不会影响月经，而且也没有不适的感觉，这样的情况是没有必要进行特殊的处理的，只需严密的观察和及时的复查就可以了。但囊肿较大，并引起月经异常的，如月经量较少、月经稀发，此种情况需及时手术摘除囊肿，并在必要的时候建议送检病理，以防止恶性病变的出现。
卵巢囊肿多数考虑是良性的病变，可以选择药物进行消炎，同时配合等一些活血化瘀的药物进行对症治疗，定期复查彩超，观察囊肿的变化。如果情况严重，必要时需要通过手术处理的。
宫颈囊肿是慢性宫颈炎的一种，一般无明显症状，而慢性宫颈炎的主要症状是白带增多，由于病原菌的不同，白带的颜色、量也有所不同。定期做妇科检查，早发现、早诊断、早治疗。经期前后及产后要特别注意营养的摄入补充，注意控制自己的情绪，保持开朗乐观的心情。饮食上给予高蛋白、高热量的食物，以增强体质，避免刺激性食物，避免饮酒。
怀孕初期检查有囊肿，一般指的是怀孕同时合并附件囊肿。妊娠合并附件囊肿绝大多数都是良性病变，发病原因与内分泌功能紊乱以及遗传因素和环境因素等多种原因有关。囊肿体积较小时一般没有明显的临床症状，也不会对妊娠过程造成大的影响，一般无需进行特殊处理，注意定期复查。如果囊肿体积比较大，或者是妊娠期症状比较明显，可以在怀孕满三个月后选择合适的时机进行治疗。
怀孕初期检查有囊肿可通过以下方式进行处理：
妊娠早期发现有囊肿可能是妊娠期间伴有的附件囊肿。妊娠伴有附件囊肿通常是一种良性的疾病，其病因包括内分泌功能失调、遗传、环境等。如果囊肿体积小，没有任何的临床表现，基本不会对怀孕产生什么不良的影响。如果妊娠时有严重的附件囊肿，伴随着孕周的延长而发生腹部疼痛，甚至会对怀孕造成一定的阻碍。如果囊肿的大小或者妊娠时的症状比较严重，可以在妊娠三个多月后进行适当的处理。对于高度怀疑恶性肿瘤的患者，应该尽早进行手术治疗。
卵巢囊肿如果不大，就不需要治疗。盆腔积液是盆腔炎的表现，如果不超过一厘米，是属于生理性的。卵巢囊肿可以考虑在月经干净后复查一次，有生理性的卵巢囊肿到时候会自己消失。