脑膜炎可以通过穿刺、磁共振等检查明确具体情况。
在确诊脑膜炎时，要根据病人有没有头痛、恶心、呕吐、颈部肌肉麻木、抽搐、谵妄等神经系统的表现明确具体情况。如果有以上的表现，可以进行穿刺检查，确定脑脊液的性质和病因。如果是脑膜炎，可以通过磁共振来检测，但是很难对其进行明确的分类，因为只是因为脑膜炎症的变化而导致的，如果是轻微的脑膜炎，可以通过药物来缓解，如果病情加重，会危及到病人的性命。
小儿脑膜炎应该做以下检查。
脊液检查─化学检查─蛋白质检查，脑嵴液病原体检查（CSF），脑脊液细菌培养等，脑脊液的一般性状检查，聚合酶链反应技术、血常规、胸部平片、胸部MRI等。在临床上常见到脑嵴髓膜炎症和颅内感染等症状相似者，容易混淆，造成误诊。确诊脑炎，用特异性抗体检验或者病毒分离，可以进一步阐明病原。
CT、MRI检查。病变早期CT或颅脑MRI检查可正常。有神经系统并发症时可见脑室扩大、脑沟变窄、脑肿胀、脑移位等异常表现。并可发现室管膜炎、硬膜下积液及局限性脑脓肿。增强MRI扫描对诊断脑膜炎比增强CT扫描敏感增强。
病毒性脑炎的诊断主要通过病毒学和免疫学的检查而确定，但是目前病毒类型尚难通过敏感及特异的分子生物学检测方法而确定，故其早期诊断主要依赖临床表现，脑电图检查，脑脊液常规生化检查及头颅CT/MRI检查。
脑膜炎的诊断要综合考虑患者的症状、体征、头颅CT、血常规、脑脊液的常规检查、脑脊液的免疫检查等。
脑膜炎的病人有可能会有头疼、恶心、呕吐、颈部僵硬等表现。如果头部CT显示有脑水肿，没有其他的症状，脑脊液细胞学和病原学检查有致病微生物，可以诊断为脑膜炎。脑膜炎一旦确诊，应积极使用敏感的抗生素进行抗感染治疗，并要注意减少颅内压、改善脑代谢、缓解脑水肿等。
临床上，如果是急性脑膜炎，首先要做常规检查，比如血液分析、c反应蛋白、红细胞沉降率、降钙素原、病毒筛查、肝肾功能等。
同时还要抽取脑脊液进行化验，看看是病毒性脑膜炎还是细菌性脑膜炎、隐球菌脑膜炎。还需要做头颅磁共振检查，看看是脑膜炎还是脑膜脑炎。如果患者还有癫痫，需要做脑电图检查，排除脑膜炎等继发性癫痫的可能。