克林霉素甲硝唑搽剂的祛痘效果一般比甲硝唑凝胶要好一些。
两种药物都是抗炎杀菌的外用药物。其中克林霉素甲硝唑搽剂，可以抑制菌体蛋白质合成，杀灭痤疮丙酸杆菌，并减少表皮脂肪酸生成，有利于痤疮治疗。而甲硝唑凝胶大多是用于厌氧菌的治疗，虽然也能起到一定祛痘效果。但相较于克林霉素甲硝唑搽剂，甲硝唑凝胶治疗面较窄，祛痘效果也会较差一些。需注意的是，两种药物都可能会出现皮肤过敏的症状，患者需在医生指导下使用，避免出现不良反应。必要时，也可通过光子嫩肤的方式，改变局部皮肤结构，促进组织生长，可缓解长痘痘的临床症状。
克林霉素甲硝唑搽剂采用科学的配方，能够有效的对付痤疮。对于引起痤疮的各种细菌有很好的抑制作用，治疗效果明显。使用之后不会产生反作用。但是，因为其属于直接接触皮肤类药物，所以使用时不能大面积的涂抹。此外，对克林霉素甲硝唑搽剂过敏者也许谨慎使用。
甲硝唑凝胶祛痘的效果还可以，甲硝唑有片剂、针剂。甲硝唑凝胶就是用甲硝唑制成的外用药，可以用来涂抹脸上的痘痘，但单纯的甲硝唑凝胶难以有效的抑制痤疮。长青春痘是痤疮最轻的皮损表现形式，要采取综合性治疗。平时要清淡饮食，多吃蔬菜水果，少吃肉类，少吃脂类高的食物，忌甜食，忌辛辣刺激性食物。
通常情况下，甲硝唑凝胶不祛痘印。具体分析如下：
甲硝唑凝胶可以阻碍细菌代谢，促其死亡，进而达到消炎的效果，通常用于治疗炎症性丘疹、脓疱疮、酒渣鼻红斑等病症。一般来说，甲硝唑凝胶不祛痘印，建议患者不要私自使用药物，需遵医嘱使用。如果要祛痘印，患者可以遵医嘱使用重组人表皮生长因子凝胶、积雪苷霜软膏等药物来促进痘印淡化，促进皮肤健康。
甲硝唑凝胶是能够祛痘的外用药物，通常结合15%壬二酸一起使用，加大治疗效果。痘痘的产生简单来说与油脂分泌过多、毛孔堵塞、皮肤细菌定植及炎症过度反应等相关，是一种发于毛囊皮脂腺的慢性炎症性皮肤病。甲硝唑凝胶是临床被大家所熟知的抗菌药物，特别是抗厌氧菌，具有很好的杀菌抗炎的效果。15%壬二酸是一种刺激性较小的酸，具有改善毛囊角化问题，抑制皮脂分泌，改善皮肤氧化，抗炎杀菌的作用。两者协同使用对治疗痘痘效果更好。建议患者在日常面部清洁后早晚使用甲硝唑凝胶，可点涂或厚敷于患处。夜间可以在使用甲硝唑凝胶后配合使用15%壬二酸，达到改善肌肤，加快疗效的作用，外敷三十分钟后即可清洁进行后续护肤。为了控制痘痘的产生还应注意少吃高糖及乳制品，保证充足的休息，调节好心情。在使用酸类产品后注意严格防晒，防晒做好，不仅对皮肤是一种保护，同时也能改善皮肤炎症。
甲硝唑凝胶主要是用于治疗细菌性阴道炎和滴虫性阴道炎，由于甲硝唑凝胶具有抗厌氧菌的作用，所以将甲硝唑凝胶和克林霉素混合后，有一定祛痘抗炎作用。单纯使用甲硝唑凝胶是不能祛痘，而且对痘痘的抗炎作用不明显。但对于有细菌性阴道炎的女性，常常就需要使用甲硝唑凝胶来进行阴道上药治疗，而且还需要口服替硝唑片进行全身给药治疗。