早期的甲沟炎用理疗、外敷等措施，使用碘达明或抗生素。脓液的形成可以被切断和排出。在床下，应该去除脓液。早期采用热水浸泡或热敷患指、石膏、理疗、抬高患肢等疗法，一般能消退脓液，可作在指甲沟纵向切口引流。当感染已经影响到指甲周围的皮下区域时，可以在指甲两侧的沟槽上做纵向切口，使指甲上皮层翻起，拔除指甲。
患者可以是进行清创治疗，把里面的脓液以及微生物清除来，再用碘伏消毒，再涂消炎药。这必须在医院里进行操作，自己是没法操作的，平时还需要注意自己的个人卫生。饮食要清淡，不要吃辛辣性食物，这样都有利于疾病的恢复。
治疗甲沟炎要选用抗生素治疗，建议口服抗菌药。同时进行软膏外涂，起到杀菌、软坚散结的作用，可以有效控制炎症。如果已有脓肿，说明病情严重，可以去医院进行切开引流术甚至是拔甲术。平时可以用黄连、大黄研成末并调和白醋敷在患处，也可以在泡脚或者泡手时少加一些食盐，对甲沟炎有一定的疗效。
甲沟炎早期治疗可用热敷、理疗、外敷等措施，或者用消炎药物消肿止痛。严重者必要时须行拔甲术，拔甲时，应注意避免损伤甲床，以免影响指（趾）甲新生。合并灰指甲的还应治疗真菌感染。患甲沟炎后注意保持局部清洁，及时就医。
甲沟炎是很难治好的，因为大多数的甲沟炎是有一定的诱因或者是危险因素存在的，如果这些因素一直持续存在，那么甲沟炎就很容易复发并且难以治好。甲沟炎主要是由于局部皮肤指甲异常等相关因素造成的细菌感染，如果目前处于急性期，需要积极的抗感染治疗才行。