是由于真菌感染引起的疾病，具有较强的传染性，所以应口服抗真菌药物治疗，创造一个无菌的环境，并杀灭体内真菌，采用泡脚修甲、或使用穿透性较强的外用药外敷，不要随意拔除倒刺。
脚上有灰指甲的治疗方法有保持足部清洁干燥，穿宽松透气鞋子，每日泡脚。在医生指导下口服药物，用于灰指甲治疗需服药3~6个疗程，服药期间需定期复查肝肾功能，出现异常及时调整用药。用干净锉刀将患甲磨平、磨薄，每日涂抹醋酸大蒜水。平时不要与他人共用鞋袜，以免出现交叉感染。
脚上有灰指甲需要及时的治疗。治疗应该以抗真菌为主。每天用药物涂抹，每周1次或2次外用，连续10个月以上，同时服用药物治疗，药物应该在饭后服用。口服与外用往往可以提高治好的几率。
脚上大拇指长灰指甲了应该做个真菌镜检，明确诊断，如果是的话，需要口服抗真菌的药物治疗。用药前查肝功，肝功能正常之后再服用，注意鞋袜的卫生消毒，保持脚部干燥。不要混穿鞋子，防止出现传染。另外出现疼痛还要注意是否有炎症发生，应该就医检查一下，在医生指导下进行治疗。
灰指甲可以选择使用抗真菌的药物进行治疗。平时尤其需要避免吃一些抗生素类药物，因为这类药物容易引起病情的加重，而且与其他人接触要做好保护措施，以免对方有伤口的情况下出现传染的可能。