一般情况下，大拇指甲盖凹凸不平可能是缺钙、甲癣等因素造成的，具体内容如下：
1.缺钙：如果患者存在营养不足的情况，体内可能会缺钙，可能会对指甲的生长造成一定的影响，可能出现大拇指甲盖凹凸不平的情况。患者可以遵医嘱使用葡萄糖酸钙口服溶液等药物进行治疗。
2.甲癣：真菌感染可能诱发甲癣，可能导致患者大拇指甲盖凹凸不平，还可能变脆、发黄。患者应及时就诊，遵医嘱使用盐酸特比萘芬软膏等进行治疗，以免病情进一步发展。
指甲凹变，一般见于指甲上出现一些横纹、竖纹以及斑点等。指甲的这种变化与机体的组织器官的功能低下，组织结构的破坏、萎缩等病理变化都是密切相关的。指甲表面不够光滑，出现一条条的直纹，一般会出现在操劳过度、用脑过度后；在睡眠不足的时候，这些竖纹会很清楚地显现出来。
大拇指指甲凹凸不平，可能是多方面的因素导致。最常见的可能是局部的外伤而形成的甲母质功能障碍，最终形成甲板的凹凸不平。也有可能是慢性湿疹，或者是银屑病以及其他的皮肤病继发形成的指甲凹凸不平。当然也有可能是甲真菌病而造成的指甲的损害，最终形成甲板的变形。另外，也有可能是微量元素的缺乏导致甲板形态异常。
一般情况下，大拇指甲盖凹陷是系统性疾病、银屑病等原因导致的。具体情况分析如下：
大拇指甲盖凹陷的原因有很多，有些是系统性疾病导致的，比如严重的贫血、呼吸系统、心血管系统等，通常会导致指甲甲母质部位供血、供氧障碍，从而抑制甲母质细胞的功能，导致甲母质细胞功能受到抑制，形成凹陷，甚至出现倒甲，形成匙状的倒甲，这就是匙状的甲壳。还有一些是指甲周围的皮肤病，比如银屑病，会影响甲母质的功能，指甲上会出现很多点状的凹陷，称为顶针甲。甲板凹陷是甲真菌病和甲癣的病变。
大拇趾根部是第一跖趾关节的位置，该处疼痛的原因多数是第一跖趾关节炎导致的。第一跖趾关节炎，多见于拇外翻患者，因拇外翻导致第一跖趾关节向外脱位，内侧的关节囊韧带被拉长而变薄弱，关节变形后受到异常应力的刺激，容易产生关节的退变性炎症，如果病史较短，畸形较轻，可以局部外用软膏治疗，并减少活动，每日热水足浴。
大拇指关节痛可能是类风湿关节炎、手部腱鞘炎、痛风等导致的，
如果出现大拇指关节痛的症状，需要到医院及时就诊。平时可以局部热敷，可以他林软膏涂抹关节处并进行治疗，也可以吃非甾体类抗炎药来治疗，如布洛芬，氯唑沙宗片等来治疗。平时也要保持充足的睡眠时间，不要熬夜，应多休息，不要做激烈的运动，也要避免登山、爬楼梯。
