指甲凹陷与甲母质外伤、银屑病甲、甲营养不良引起。随着甲母质受伤时间的延长，末梢循环的障碍，指甲凹陷区域变宽变深，有全身红斑伴鳞屑、瘙痒的银屑病病史，甲真菌病、会引起指甲凹陷。
有可能和最近重体力劳动有很大的关系，因为经历了长期的重体力劳动压力下，会阻碍指甲末端的血液循环，长期以往导致指甲出现凹陷，健康人的指甲色泽粉红。把十个指甲放在阳光下观察，手指上下移动，如指甲表面有闪耀的反射，那就显示整体健康处于极佳状态，体内各器官的功能都完好正常。
指甲凹陷的症状被认为与微量元素和维生素缺乏有关。医院检查缺锌、缺钙和贫血是否会导致抑郁症状。钙和锌可以补充观察。贫血的症状也会导致指甲凹陷。适当的补铁和注意饮食调节观察。通常，动物内脏、瘦肉、蔬菜和水果应该多吃观察。通常多吃含钙食物。
指甲盖凹陷是的原因是缺铁性的贫血，当手指甲出现凹陷时和缺铁有很大的关系，缺铁本身不会导致指甲的畸形，但是缺铁的时候会让指甲内的胱氨酸量低于正常，同时还会出现头晕、头痛、烦躁。
手指甲凹陷是一种常见的甲畸形，多称作匙状甲或反甲，以甲板变薄，中央凹陷而周围隆起呈匙行为特征。可能是工作时长时间接触强碱性肥皂或石油产品所导致的。也可能是某些皮肤病如湿疹、扁平苔藓、冻疮、黑棘皮病、斑秃等，以及一些系统性疾病如甲状腺功能亢进或低下、梅毒、冠心病、风湿热、伤寒等导致的手指甲凹陷的现象。
有可能是由于缺乏微量元素而引起，宝宝有可能还会出现有脸色苍白或者生长发育迟缓一些症状的，可以到医院做个检查，饮食要注意营养的均衡，不要偏食，但是如果周围的凹陷还会出现有颜色的改变，有可能是真菌感染引起的灰指甲。
