出现手指甲凹凸不平，考虑是缺乏维生素和钙引起的。可以到医院进行微量元素检测，如果确诊是身体缺维生素和钙，可以通过补充钙剂的药物和食物治疗。平时多吃排骨，鱼虾等富含钙剂的食物。也可以血常规及肝肾功能检查看看，排除贫血及肝功能异常。
一般情况下，指甲盖凹凸不平有小坑可能是真菌感染、营养不良等原因导致的。
1.真菌感染：创伤后可能会导致指甲被真菌感染，造成甲癣，此时可能会出现指甲异常生长的情况，导致指甲盖凹凸不平有小坑。
2.营养不良：如果缺乏营养，可能会导致甲营养不良，造成指甲生长比较慢，导致指甲盖凹凸不平有小坑，平时要适当补充营养，多休息。
可能是过性的损伤甲床，从而形成指甲的不平。另外如是缺乏微量元素，缺乏必要的营养物质尤其是蛋白质，严重消耗性的疾病，如严重的肝病、糖尿病等，也可以导致指甲凹凸不平。
大拇指的指甲出现这种改变，多和甲床功能异常有关，也有真菌感染的可能，缺铁缺钙所致的指甲异常，多会包括所有的指甲的，可以到皮肤科检查看看，如果是真菌感染可以用药物治疗。
如果指甲出现凹凸不平，多见于缺乏维生素或者是微量元素导致的，如果比较厚，应该是真菌感染，颜色改变，俗称灰指甲，一旦确诊灰指甲以后注意局部的清洁卫生，多吃含铁，蛋白质的食物，如木耳，大枣，乌鸡等。再配合中药调理一下体质。
说明你身体是在起伏不定的，指甲是肝肾的反应，指甲是筋之余，筋为肝所主。指甲凸起那一阵子，说明你营养好，肝肾足；指甲凹那一阵子说明你肝肾不足，平时注意节欲就好一些。
