治疗毛囊炎脱发可利用药物控制、养成良好的生活习惯等。
脱发性毛囊炎是一种炎症性疾病，本病多见于头部脂溢性皮炎，患者因感染金黄色葡萄球菌所致，可累及任何长毛的部位。临床上治疗一般外用抗生素和糖皮质激素软膏，而泛发性的损害，需口服抗生素。病情严重者，病需要糖皮质激素与抗生素融合用。如果已形成肿脓疱，患者应该在医生的指导下早日切开引流，并使用敏感性的抗生素，如此有利于治疗效果向好。患者的衣帽、毛巾、面盆禁止公用，防止接触传染。此外，还应对患者进行隔离，避免出现交叉感染的情况。
可以服用维生素B2和维生素B6，抑制皮脂的分泌，也可以用复方硫磺软膏洗发。不舒服合用碱性很强的洗发精洗发，注意皮肤清洁，增强机体抵抗力，预防外伤，积极治疗瘙痒性皮肤病及全身慢性疾病。头皮的毛囊炎患者需注意随时保持头皮凉爽，改善过度洗头习惯。
毛囊炎有可能出现脱发。出现毛囊炎，一般是由于细菌感染或者真菌感染引起的。主要表现为毛囊根部出现红肿疼痛现象，严重的出现化脓。要注意保持局部清洁卫生，避免搔抓，防止感染。坚持使用消炎药物治疗，控制感染。
毛囊炎引起脱发。毛囊炎可反复发作形成慢性毛囊炎，发生于头皮的可引起永久性脱发;发生于项部的，皮损呈乳头状增生或形成瘢痕硬节，不易好;毛囊炎向深部发展，可引起毛囊周围炎，称为疖，多发且反复发作的疖称为疖病，严重者可有淋巴结肿大、发热、头痛，甚至引起脓毒血症或败血症;如果挤压位于鼻、口唇部位的疖肿，可使病菌经血行进入颅内，引起化脓性血栓性静脉炎或脑脓肿，可导致死亡。
发性毛囊炎的治疗方案与一般的毛囊炎治疗方案相似，在治疗之前需要化验脓汁细菌培养以及药敏，找到相应的致病菌，并且找到对应的抗生素治疗，往往效果比较好。可以应用的抗生素软膏，也可以口服药物。并且病人不要使用甜食、辛辣刺激的饮食。
毛囊炎所导致的脱发，有些是可以重新长头发的，有的是不能够。比如复发性的毛囊炎，经过治疗以后，头发大多数是可以长出来的，但是另外一种叫穿凿性的毛囊炎，因为毛囊炎特别容易导致皮下的穿孔，然后形成硬结，形成疤痕增生，会导致毛囊炎预后，会局部出现秃发。
