梅毒晚期可以在小腿部位形成树胶样肿，鼻中隔骨质破坏，可以形成马鞍鼻。皮下可以形成纤维结节，呈对称性，大小不等，质硬，不活动。晚期梅毒主要表现为心血管梅毒以及神经梅毒，心血管梅毒一般主要是主动脉受到侵犯，可以发生主动脉瓣闭锁不全，引起梅毒性心脏病。神经性梅毒可以表现为梅毒性脑膜炎、脑血管梅毒、脑膜树胶样肿、麻痹性痴呆等，还会出现颅内压增高、头痛、局部压迫症状，有的可以表现为感觉异常、共济失调等。
晚期毒可表现为麻疹痴呆，脊髓结核可引起视神经萎缩，会导致残疾，严重的话会危及生命。因此，梅毒的治疗在早期显得尤为关键。病人如果在早期能及时得到治疗，那么便不会发展为晚期。
临床上梅毒出现的症状主要有硬下疳、梅毒疹等。
梅毒是一种性传播性疾病，一期症状主要是硬下疳，二期是梅毒疹。随着病情的发展，主要有头痛、口齿不清楚等表现，部分病情严重的患者也可能会导致脑梗死，或者会影响到神经，导致脑膜炎。
如果病人表现出可疑的症状，应该立即去医院做相关的体检。
梅毒引起的皮肤瘙痒的初期表现，是在手心或者足掌上起红色的斑点。这种红色斑点一般是一种散开或散布的，不会引起任何的瘙痒和痛苦。大部分的红斑都伴随着少量的鳞片和脱落。梅毒的皮疹往往是第二阶段的。
除梅毒初期的皮疹之外，一些患者还会出现肛周的扁平湿疣，典型的是扁平的疣体，其外表湿润，没有明显的症状。所以，在梅毒的皮疹中，如果在早期就能察觉到这种变化，那么到了医院是非常重要的。
晚期梅毒症状除损害皮肤粘膜引起梅毒性结节、树胶肿、近关节结节等病症，体重减轻、全身不适、慢性腹泻、全身淋巴结肿大、口腔粘膜溃疡。还能侵犯神经系统、心血管以及各内脏并可导致机会性肺部感染或多发性出血肿瘤等严重疾病。
晚期梅毒又叫三期梅毒，都是在一期二期没能彻底得到很好的治疗，从而导致病情发展到三期。大约有40%未经治疗的梅毒病人可发展为晚期梅毒。一般于感染后10~30年可侵犯心血管和神经系统。晚期梅毒的特点是传染性很小，但对组织的破坏性较大，严重时可危及生命。