通常情况下，阴囊皮脂腺囊肿可以通过手术治疗。
阴囊皮脂腺囊肿是一种良性病变，并不是很大，也不会对病人造成什么影响，所以可以先观察一下。如果这种情况在短期内发展得很快，可能会给局部带来压力，出现坠胀的感觉，那就需要手术切除了。阴囊皮脂腺囊肿在手术的时候，可以选择少量的病理组织进行检查，以排除恶性的可能性，但这种可能性很小。
皮脂腺囊肿的表现多为皮下肿物，中央有的有开口，按压或者会自行流出皮脂，多伴有臭味。但有的病人皮脂腺囊肿表面与明显开口。一般发生在背部等受压部位，皮疹会比较深，部分呈葫芦状。无压痛或者瘙痒。
一般情况下，耳朵皮脂腺囊肿，如果患者的病情较轻，可能会自愈；但如果患者的病情较重，通常不会自愈。具体情况分析如下：
有些患者的耳朵皮脂腺囊肿比较小，一般不会持续增大，过一段时间可能会逐渐消失。但是也有一部分患者，如果耳朵上的皮脂腺囊肿比较大或者逐渐增大，需要手术切除。如果囊肿继发感染导致局部肿胀疼痛，需要做囊肿切开引流手术。
如果不注意身体卫生，就容易形成毛囊堵塞，导致毛囊炎感染，建议平时多喝水，注意清淡饮食，避免食用高脂肪高热量的食物，避免吃辛辣刺激食物，红肿结节可以涂些碘伏或者软膏消炎治疗，毛囊炎严重的可以吃些抗生素。中医治疗方面，主要是吃一些清凉去火的中成药。
一般皮脂腺囊肿不能自行消除。
皮脂腺囊肿不是因为皮脂腺的分泌管堵塞，导致其上皮中的物质不断增加而产生造成的。皮脂腺囊肿可以持续数年而不会出现明显的临床表现，但是也会出现感染、破溃、复发等情况。囊肿壁有分泌作用，可产生内含物质，若不彻底清除，则容易发生反复；当囊腔的内膜腔破溃，里面的物质流出时，很容易引起炎症。皮脂腺囊肿可以通过一些特殊的方法进行彻底的清除或者是彻底的摧毁。