甲沟炎可以涂抹一些具有消炎杀菌作用的中药来进行外敷，也可以配合一些消炎药或者其他抗生素进行消炎杀菌处理。甲沟炎如果特别严重，药物治疗没有什么效果，应该通过手术的方式来彻底的治疗甲沟炎。甲沟炎是由于嵌甲引起的，所以建议炎症好转后，不用过度修剪甲侧缘，避免嵌甲加重，只要不过度修剪甲侧缘，嵌甲会逐渐长回来的。
局部有红肿疼痛建议使用消炎抗菌的药物涂抹治疗及外用消毒涂抹周围皮肤组织，尽量避免其它部位发生感染。找出引起甲沟炎的起始原因，遵医嘱涂药。如果有脓液形成时，一般需要切开引流，拔甲，手术治疗。
治疗甲沟炎是循序渐进的过程，当发生甲沟炎时，如果有指甲长进肉里，先要将嵌入肉里的指甲剪除，如果局部发生脓肿，可以通过切开引流的办法，将局部清疮。充分清理后，可以在局部涂抹软膏，能有效地防止甲沟局部发炎、感染，从而促进甲沟炎的痊愈。
甲沟炎需要去正规医院的普外科或者是皮肤科，按医嘱用药比较好。甲沟炎即在甲沟部位发生的感染。甲下脓肿即指甲与甲床间的感染。甲沟炎多因甲沟及其附近组织刺伤、擦伤、嵌甲或拔“倒皮刺”后造成。
平时可以用碘酒在指甲的两侧涂抹，碘酒除了可以杀菌、抗炎外，还可以促进甲沟内组织的新陈代谢，也可以在局部涂抹莫匹罗星软膏，能有效地防止甲沟局部发炎、感染，从而促进甲沟炎的痊愈。