手指甲根部凹陷多考虑是有维生素缺乏引起的症状，一个人必须营养好，指甲才能正常生长，否则就会出现一些异常的现象。胃肠功能不好，营养吸收差，精力不旺也可引起。
指甲有凹陷与有可能是因为先天性原因导致的，在刚出生的时候出现所有指甲中间凹陷的表现，有可能是后天性形成的，可能是血液循环发生障碍，或者是甲母质出现了一定的功能障碍，而形成的甲营养不良症。
无名指指甲凹陷可能是外伤、真菌感染、甲根瘤等原因导致的。
1.外伤：无名指指甲凹陷有可能会有凹痕，首先是因为指甲受到了创伤，造成了甲板的扭曲。
2.真菌感染：菌感染是最常见的病因，也是因为一些霉菌会影响到甲板。也会出现甲板变黄、增厚、不规则等情况。
3.甲根瘤：甲根瘤可能会导致甲根部的甲母质受到挤压而导致的，造成无名指指甲凹陷。
考虑由于营养不良造成的凹陷，例如缺乏维生素、微量营养素和营养失衡。不能对部分食物挑剔，一定要给宝宝足够的营养平衡，多餐少吃，不要吃得过多，适当补充钙和锌，随时重新审视、调整喂养计划。
指甲盖凹陷是一种常见的甲畸形，多称作匙状甲或反甲，以甲板变薄，中央凹陷而周围隆起呈匙行为特征。很多种疾病都可以表现为指甲病变，比如比较常见的银屑病，可以在指甲上形成凹陷、凹坑、凹点。
大拇指甲凹陷是勺状甲特征，大部分属于甲营养不良症的一个类型。而甲营养不良症的发病原因很复杂，大多是由于甲母质的部位出现了营养功能障碍，或者是机体末梢循环的障碍导致。