考虑是体内出现缺锌，钙，及维生素引起的。指甲是由皮肤角化生成的，内充满角蛋白质。皮肤缺少锌钙维生素等营养，就会出现指甲凹凸不平及竖纹现象。所以富含蛋白质和钙，锌的食物是保持健康、光滑、亮泽指甲的基本要素。
手指甲上有坑和竖纹应该是严重缺乏微量元素引起，平时饮食要营养搭配均衡，多吃些含钙和维生素比较高的食物，多喝牛奶，可口服钙片加多种生素片，按疗程服用，会对症状有所改善。
手指甲有竖纹和凹陷的小坑可能是近期过度劳累、长期熬夜、饮食不规律，导致体内微量元素缺乏、营养不良有关，也可能是慢性疾病的表现，比如慢性肠胃炎。还有可能是感染了灰指甲导致的。
手指甲应该是光滑的、平滑的、有光泽的，但是如果出现了竖纹，都是一种生理性的，生理性就是一些正常的表现，没有什么特别的含义。需要注意的是有一些比如外伤引起的这种竖纹或者是横纹都会出现，还有一种需要更重视的就是甲营养不良，就是指的维生素、微量元素的缺乏所导致的，可以到医院找专科的大夫进行咨询或者是用药物来治疗。
手指甲出现竖纹和凹陷，可能是由于营养不良原因导致的指甲变形，多半是缺铁、缺锌、缺钙的原因引起的，也是慢性疾病的表现，比如慢性肠胃炎。如无其他异常现象，可以针对微量元素检查，如果存在缺锌和缺钙症状的，可以通过补锌和补钙进行治疗，进指甲恢复正常光滑。
银屑病早期，很多病人的指甲表面可以出现一些凹陷，而这些凹陷相对独立，密集排列，所以有人称为顶针状外观。真菌感染，也就是平常说的灰指甲，在灰指甲的早期，也可以出现一些点状的坑。另外，其他疾病比如扁平苔癣，也可以在指甲表面出现小坑，而且逐渐增多。除此之外，还有甲营养不良，也可以在指甲表面出现不同的坑。