妊娠合并生殖器疱疹的治疗方法一般有局部用药、全身用药等，具体内容如下：
1.通过局部用药可以保护疱疹的粘膜，使用生理盐水清洗阴道，使其干净、乾净。用甲紫溶液或阿昔洛韦乳膏或乳霜涂抹于病变部位，或使用酞丁安软膏。如果有明显的痛楚，可以在局部应用盐酸利多卡因软膏或口服镇痛药物，也可以将奥平的栓剂放入阴道。
2.全身用药一般建议口服阿昔韦，反复发作者应长期口服。怀孕期间要按照医生的指示服用。阿昔洛韦治出现任何其它不良反应，通常只是暂时降低嗜血因子引起的。
得了生殖器疱疹后要杜绝不良性生活，同时性伴侣也要同时治疗，避免交叉染。最主要还是注射增强免疫力的针剂，同时加强锻炼身体。治疗一般要保持疱疹壁完整，清洁与干燥，防止继发。
一般药物很难抑制，生殖器疱疹的复发率很高，西医叫不治之症。中医中药长期临床实践积累了很多独特的治疗方法，主要是要把体内的HSV病毒完全清除掉才行，要不能几个月以后又会导致复发。
可以适当的做一些锻炼，加强自身的免疫力，只有免疫力提高了，生殖器疱疹的率才会降低一些，但是在锻炼的时候，需要不能过度的劳累，不要长时间的锻炼，锻炼时间不能超过半个小时。一定要以清淡的饮食为主，平时多吃一点瓜果蔬菜，像苹果，黄瓜这些之类的，还要做到多喝白开水，少吃油腻辛辣和有刺激性的垃圾食物，主要的还是要戒烟戒酒。
对于生殖器疱疹的治疗，要想办法提高自身的免疫力，因为只有依靠自身的免疫能力才能吞噬掉hsv病毒，防杜绝日后的复发。愿您能够拥有健康的人生。应给予同时治疗。中医认为生殖器疱疹为肾气不足所致。在治疗上可内服补肾功能的药物。
生殖器疱疹可采用抗病毒治疗，治疗目的是缓解症状，减轻疼痛，缩短病程及防止继发感染等。生殖器疱疹是一种传染性极强的性病，通过性活动传播。从中医定性角度来看，病属于病毒性皮肤病。