生殖器疱疹会有疼痛，有的人疼痛的比较厉害，生殖器疱疹是有单纯疱疹病毒感染引起的，在生殖器官周围会出现单个的或是成簇的小水泡，几天后水泡会破裂出现糜烂和溃疡，所以会有疼痛的感觉。
生殖器疱疹一般潜伏期是2-14天左右，在皮肤上出现散在的小水疱，或者是簇集状存在的小水疱。小水疱一旦出现以后，2-4天会自己破溃，形成浅浅的溃疡，然后慢慢会愈合。此过程中会有明显的疼痛感。
生殖器疱疹是由人类单纯疱疹病毒所引发的，大多数情况下是由性生活来传播。本病患处周围会产生水泡，进而出现糜烂和溃疡的现象，所以会引发疼痛感。在得了这种病都最开始几天是不会有疼痛感的，反而会觉得莫名的骚痒。随着病情的加重，是一定会痛的。
生殖器疱疹神经痛可以采用传统中医药物配合治疗，疗效确切，这些传统中药配合使用能使体内产生一种内源性干扰，阻断生殖器疱疹病毒DNA的复制，就象给人结扎了一样，使其不能产生新的病毒，从而彻底清除生殖器疱疹病毒，达到不多的效果。
生殖器疱疹的初是进食困难，出现窒息：损害要是发生在口腔或咽喉部位的话，可出现进食困难、吞咽困难、声音嘶哑的情况，严重者甚至可因为生殖器疱疹的损害而堵塞气管，进而导致窒息而死亡，特别是婴幼儿生殖器疱疹中容易发生。
出现这种病情和生殖器疱疹有关系，另外也可见于坐骨神经痛，腰椎病变等导致，出现疼痛，可以服用药物治疗，到医院外科再复查一下腰椎片等检查看是否有异常，根据检查进行治疗。