治疗灰指甲有很多方法，一，可以把受累比较局限的甲板组织修剪掉，注意不要损害到正常的甲组织。二，是累及的指（趾）甲比较少的，可以用渗透性比较强的外用抗真菌的药膏或药水。三，如果指（趾）甲累及比较多，增厚非常明显，则要选择口服抗真菌的药物去治疗，疗程通常需要2至3个月以上。
灰指甲属于真菌性感染，主要的感染菌为红色毛癣菌、袍子菌、絮状表皮癣菌等，所以治疗时需要针对性地消除感染菌才能根除，由于灰指甲用药物治疗，药性无法渗透到指甲下面，用药却接触不到感染灶，所以泡脚可以作为治疗灰指甲的方法之一，但并不是指单纯地用白开水泡脚，里面需要添加相应的药物，具体泡脚方法需要以实际情况为准。
修脚店是不能治疗灰指甲的，拔甲二次感染的风险比较高，拔甲治疗灰指甲属于“治标不治本”的做法。拔甲只能清除掉指甲上面的真菌，甲床上的真菌并没有真正被杀死，一旦遇上合适的环境，真菌孢子苏醒，长出来的仍然是灰指甲。灰指甲属于一种真菌感染，具有传染性的，所以得了灰指甲，最后与家人隔开，不要同一种物品，去医院治疗，在家中服用药物就行。
灰指甲可以治疗。主要是各种真菌感染引起根据不同临床表现，针对性治疗。外用药物可以采用局部涂药或者封包削治。比如外涂或者泡病甲，连续3～6个月以上效果更佳，用药前可以将病甲削薄，再涂抹药物效果更佳。也可以采用抗真菌外用药物局部涂抹。也可以采用手术拔甲，主要用于单发的指甲。
灰指甲是由于真菌感染所引起的，因为真菌是具有传染性的，所以在脚部滋生得比较快，我们一定要注意这种病，因为如果不及时治疗的话就可能造成所有的脚趾都患上这种疾病，到那时就已经晚了。因为真菌可以说在我们生活中是无处不在，所以更要加紧预防这种疾病，只要我们注意个人卫生，保护好我们自己的脚，远离那些有真菌存在的地方，就可以避免发生这种灰指甲疾病。