肛门湿疣可以中西医治疗，以内外结合治疗为主，主要用清热除湿，脱敏止痒的中药口服，再加三甲、藏红花等中药药，熬夜泡洗。西医方面可以使用激光，电灼，手术治疗，还有要注意饮食方面。
肛门湿疣治疗效果的影响因素很多，除坚持肛门湿疣的治疗原则外，同时还要做好治疗期间的护理保健工作。注意清洁卫生，远离不洁性交，对生活接触物品要消毒，膳食结构均匀，多休息，确保良好的心情，避免远离各种不良情绪，对促进肛门湿疣康复的具有重要意义。
于尖锐湿疣这种比较顽固的性病，仅仅通过常规治疗，是不能够清除体内毒素的，也要从预防复发开始，这就需要养成良好的生活习惯，杜绝不洁性行为开始，如果病情再次发作，就要及时到医院进行诊断治疗，这样才能避免给身体造成更大的伤害。
电灼这种尖锐湿疣的治疗方法适合疣体数量少，且疣体的面积小的病人，此方法只把疣体清除掉，虽然不能完全的解决尖锐湿疣疾病，但是可以对尖锐湿疣的症状做有效的缓解。冷冻治疗尖锐湿疣，对疣体数量少，面积小的人合适，冷冻可以清除疣体，但缺点是比较容易发作。冷冻疗法治疗过程是用-196℃低温液体氮，是压冻法治疗尖锐湿疣，让疣组织坏死脱落。
关于肛门疣治疗方法一是关于肛门疣治疗方法二是关于肛门疣治疗方法三是关于肛门疣治疗方法四是关于肛门疣治疗方法，一定要杜绝混乱的性行为。另外，可以使用激光或者冷冻的方法祛除疣体，也可以采用咪奎莫特霜等药物。
肛门湿疣复发率很高，一般药物很难治疗，正确治疗的关键是抗复发。LEEP刀、艾拉、冷冻治疗、激光治疗、微波治疗、电烧治疗、手术刮除法治疗等。去本地正规医院检查下，再进行治疗，化学药物和物理治疗方法仅仅能够破坏疣体表面组织，治标不治本。