肛门疣初期的医治办法是做个激光手术，会比较好，手术以后，患者一定要多注意休息，平时一定要多注意卫生，大便完要及时清洗一下会比较好。尽量不要吃辛辣食物，刺激性食物，海鲜之类的。
肛门疣的初期治疗有；冷冻治疗：对外生殖器和会阴部疣液氮冷冻疗法可为首选治疗。冷冻疗法无毒性，不需要进行麻醉，若应用得当，不致引起疤痕形成。激光治疗：适用于处理广泛性疣，特别是对冷冻疗法无效者。手术治疗：对带蒂的较大，孤立的疣体，可考虑手术切除。良好的卫生习惯，避免使用未经消毒的公共用具，保持肛门清洁卫生，养成睡前便后清洗肛门的习惯。
可以用微波治疗仪治疗，作用机制以消除疣体的症状为主，微波是一种非电离性高频电磁波，具有特殊的生物学效应及优良的止血作用，微波治疗可以产生凝固，热效应和非热效应，它以生物组织本身为热源，产生不导电的热，从而达到凝固，止血，烧灼的效应，使CA皮损完全消失而好转。保持局部清洁，忌食辛辣食物。
肛门疣是一种常见的皮肤病，初期为小的淡红色丘疹，后逐渐长大，表面呈凹凸不平的柔软乳头样病变，有的呈菜花状，根部可有蒂，表面湿润呈污灰色，时间较久者表面可有糜烂渗液。注意局部卫生，避免高危性行为，防止传染，避免刺激性饮食。
尖锐湿疣是病毒感染引起的一种感染性疾病，具有很强的传染性，可以去医院皮肤性病科行激光祛除术，肛周湿疣的治疗常用的有激光、冷冻、光动力等先将疣体清除干净，后期配合药物治疗。