光动力学疗法：本法可选择性杀伤增生旺盛细胞，不仅对肉眼可见的疱疹有破坏作用，还可清除亚临床损害和潜伏感染组织。中药治疗：中医讲究标本兼治，根据个人病情及身体状况，合理组方用药，逐步达到治疗目的。
一般情况下，生殖器长疱疹通过药物治疗比较有效，具体内容如下：
如果患者曾发生过不洁性行为，可能会受到病毒的影响，可能会导致生殖器长疱。患者可以遵医嘱使用阿昔洛韦软膏、匹多莫德口服液等药物进行治疗，以缓解不适症状。此外，患者应注意日常护理，要注意保持患处清洁、干燥，要及时更换、清洗内裤，在治疗期间要避免发生性行为。
选择激光疗法治疗：一般1次即可使疱疹脱落。但是，由于激光的光束过于集中的原故，激光治疗只适用于面积较小的疱疹。中药治疗：刺激肌体产生免疫球蛋白提高自身免疫功能。
生殖器长疱疹最好是选择一线城市的公立医院治疗。到皮肤科门诊面诊看一下，明确诊断以后合理治疗，生殖器疱疹是一种比较常见的性病，主要是通过性生活传染，所以治疗期间，要避免性生活。
可以选择去专科医院治疗，这些医院是现代化的综合性三级医院，学科齐全，医学特色鲜明，综合实力雄厚。医院实现了跨越式发展，出现了一批特殊的医疗项目。随着各医院的蓬勃发展，医院规模也在不断扩大。
可采用物理疗法治疗：冷冻疗法是患者可以在零下二百多度的液氮下，进行冷冻，由此湿疣疮面便会坏死脱落。该疗法健康，简便。药物治疗：可使用腐蚀性药物破坏疱疹，或抗病毒药物控制疱疹的感染。