生殖器疱疹的并发症，主要会引起播散性疱疹，疱疹性脑膜炎，前列腺炎，直肠炎，等一系列疾病的并发症。还会导致一些腰部神经炎，脊柱炎。生殖器疱疹的危害最大的，是可能会引起，尿路系统的疾病，会导致男性不孕症。所以平时要加强锻炼，不要有不洁的性行为，提高自身免疫能力，来抵抗病毒感染。
在疱疹早期发病的时候，处会有一些成群的小丘疹，还会时不时地伴有瘙痒或者是灼热的感觉。情况严重的话就会出现溃烂，尽管这些症状在2-3周内会逐渐消退，可是还有复发的可能。
生殖器疱疹可能引发的并发症有播散性疱疹、疱疹性脑膜炎、前列腺炎、直肠炎、盆腔炎、脊髓神经根疾病等。出现这类症状时，建议及时就医。要注意的就是避免食用一些辛辣刺激性的食物，大葱、洋葱、韭菜、香菜以及一些容易造成刺激的食物都不要吃。
复发性生殖器疱疹的出现会生殖器部位出现灼热、疼痛等症状表现，同时，还会伴随着头疼、发热、肌肉疼痛、关节疼痛等全身不适的症状，而且，有些病人还会出现持续高烧，疾病的复发对病人的健康造成的伤害更大。
生殖器疱疹好了复发，迅速的变成小水疱，2到3天后破溃形成溃疡，并且剧烈疼痛，随后可结痂，自愈不留疤痕。整个过程可有发热、全身不适和头痛，也有会出现腰骶部神经的异常感觉，病程平均2到3周，但易复发。
生殖器疱疹的并发症是外阴患处会有灼热感，会发现逐渐增多成群的丘疹，进而形成小的水疱，数日后水疱会变为脓疱，并且逐渐破溃形成糜烂或者溃疡，自觉疼痛，最终结痂自愈，病程大概2周-3周。皮损多出现在男性的包皮、龟头、冠状沟等处，偶见尿道口。