传染性软疣的治疗首选刮除，以将皮损中的软疣小体完全挤出为目的，然后涂以中药，可有效去除皮损。其他如冷冻治疗，外用抗炎药物均有效。避免到公共泳池游泳，使用公共洗浴设施，与他人合用毛巾等，可避免感染。同时尽量避免搔抓，防止自身接种传染。
儿童软疣的治疗方法主要有药物治疗、物理治疗等。
传染性软疣是一种具有传染性的疾病，可在医生指导下使用人干扰素a2b凝胶。如果疣体数量较多，还可以选择激光治疗、冷冻治疗等，这样既安全又快速。平时应注意避免儿童对疣体进行挤压、抓挠，保证其营养元素摄入均衡，养成规律的作息习惯。
不能彻底治愈，因为本病是一个病毒感染类疾病，在搔抓或者弄破皮损以后很容易自体接种而导致皮损数目的增多。治疗最主要的是采用刮匙或者镊子等把皮损夹掉，同时一定要把衣服，尤其是贴身衣服烫洗、暴晒。
儿童软疣如做好护理可以根治。
儿童软疣是由传染性软疣病毒感染引起的一种传染性皮肤病，皮损表现为特征性有蜡样光泽的丘疹或结节。该病一般具有自限性，若是身体免疫力较强，平时做好护理，及时治愈后通常可以达到根治的目的。
平时需注意保持环境卫生，减少病菌滋生。
感染后的阴囊上有感染性的软疣是可以治疗的。传染性软疣是由于感染性软疣病毒引起的，一般情况下，免疫力强的人可以自行恢复。不过，如果病人的免疫力低下，体内有持续增殖的病菌，一定要注意，要根据自身的病情，去正规的医院皮肤科就诊。可以口服或外用，甚至激光、冷冻等，但不能擅自使用，否则会对人体产生不良影响。