肛门湿疹在治疗的时候主要是使用中药坐浴和内服一些消炎药抗敏药，外用一些皮肤类的软膏方法来进行治疗，其中使用中药坐浴治疗时注意不能用超过40度的水来清洗肛门周围皮肤。
患有肛门湿疹的治疗方法是外用药膏或者中药坐浴。在肛门湿疹的治疗方面，主要还是使用祛湿止痒，消炎杀菌的药膏涂抹治疗。药物治疗期间也应该多注意个人的肛门卫生，可使用温水清洗，另外要穿宽松透气性好的内裤，平时也要勤洗澡，勤换洗衣物，不要过多劳累也不能久坐，这些方面都可以预防肛门湿疹复发。
肛肠湿疹，主要是与肛门部的皮肤受到真菌和细菌感染有关系，同时也可能与肠液流出肛门外，刺激肛周皮肤有关。要注意保持肛周的洁净。同时穿宽松透气性好的棉质内裤，避免过多的摩擦局部皮肤。
一是保证健康的生活状态和精神心理状态；二是要保证大便的通畅，规律排便。平时穿内裤不可过紧、过硬磨擦皮肤，不要用带化工染料以及带有油墨字迹的纸张、植物叶等揩擦肛门。
肛门湿疹最主要的症状就是会出现瘙痒，疼痛，还有局部异味等。目前这个病可以通过局部给药来治疗。但是平时的生活中也要注意局部的清洁卫生，勤洗屁股，勤换内衣裤。饮食上要注意吃清淡的食物，禁忌辛辣刺激，还有海鲜类的食物也不要吃。
用药的同时注意自我保健，保持身心健康，养成良好的生活习惯，加强锻炼。对身体微小的不适及病变，要积极治疗，如热水洗烫，过度搔抓，避免接触一切可疑致病因素，如化妆品，寒冷等。中医治疗肛门湿疹简便、经济、效果好，目前治疗肛门湿疹几乎都离不开中药。中医治疗肛门湿疹分内服、外洗、针灸三种方法，三法配合使用能收立竿见影之效。