肛门湿疹在治疗的时候主要是使用中药坐浴和内服一些消炎药抗敏药，外用一些皮肤类的软膏方法来进行治疗，其中使用中药坐浴治疗时注意不能用超过40度的水来清洗肛门周围皮肤。
肛肠湿疹，主要是与肛门部的皮肤受到真菌和细菌感染有关系，同时也可能与肠液流出肛门外，刺激肛周皮肤有关。要注意保持肛周的洁净。同时穿宽松透气性好的棉质内裤，避免过多的摩擦局部皮肤。
一是保证健康的生活状态和精神心理状态；二是要保证大便的通畅，规律排便。平时穿内裤不可过紧、过硬磨擦皮肤，不要用带化工染料以及带有油墨字迹的纸张、植物叶等揩擦肛门。
使用外用的药膏涂抹治疗。随身衣物要冲洗干净，残余在衣物毛巾中的洗洁精可能刺激皮肤。还要适当的增强运动量，运动能增进血液循环，增强皮肤抵抗力，不要用手抓挠或者是频繁地用纸巾擦拭肛门附近。
患有肛门湿疹的治疗方法是外用药膏或者中药坐浴。在肛门湿疹的治疗方面，主要还是使用祛湿止痒，消炎杀菌的药膏涂抹治疗。药物治疗期间也应该多注意个人的肛门卫生，可使用温水清洗，另外要穿宽松透气性好的内裤，平时也要勤洗澡，勤换洗衣物，不要过多劳累也不能久坐，这些方面都可以预防肛门湿疹复发。
