指甲里有细小短黑线可能是黑母痣或者是甲霉菌感染等原因引起的。
黑母痣是指甲母位置的良性肿瘤。黑母痣一般不会有进一步的恶化，但是如果有增宽、颜色变深的话，可以通过手术切除，将其完全去除。也有可能是甲霉菌引起的甲板黑线。也有一些是手指受伤，或是局部接触洗涤剂导致的黑色丝状条带，这些都会自行消失。
日常生活中，要注意指甲的卫生，勤洗手，避免接触不良物品，有利于指甲健康。
指甲有黑线，可能会有以下原因造成的：指甲遭受外物的撞击，造成甲板下的毛细血管破裂，从而显现出这种症状，这种症状是不需要处理的，随着时间增长会慢慢消失。也有可能是灰指甲造成的，灰指甲的真菌会破坏甲板的结构，使甲板出现纹路或者是颜色改变的情况，这种情况需要及时的进行抗真菌的治疗。如果患者经常从事体力劳动，则也有可能是身体极度疲劳，缺乏休息的时间。
一般情况下，指甲里有黑线可能是甲床出血而显现出的症状，也可能是指甲感染真菌，具体内容如下：
1.甲床出血：指甲上有黑色的纹路，一般是因为指甲被撞击或者是美甲的时候划伤了，导致甲床流血，进而造成指甲里有黑线。
2.指甲感染真菌：由于指甲被真菌所致，也就是所谓的灰指甲，这种真菌会腐蚀掉指甲，导致指甲逐渐发黄，有黑线，并且容易掉落。
最有可能的是甲母痣。表现为指甲上单发的，也可能是多发的，纵向的黑线。黑线与周围指甲的界限很清楚。这是由于指甲下方的痣细胞增生，产生色素导致的。如果指甲上出现多发的甲母痣，提示身体免疫功能有所下降。甲母痣都是良性的，平时观察就行。
指甲有黑线是否严重与指甲黑线程度有关，指甲黑线的原因是甲母质黑素增加，黑素增加有黑素细胞良性和恶性增生，恶性增生提示恶性黑素瘤。如只是黑素细胞活性增加导致色素增加引起指甲变黑，则影响不大，可不处理，症状不厉害。
通常情况下，黑色素细胞的改变是导致指甲出现黑线的主要原因。这主要是因为黑素细胞激活，使黑素细胞活跃，增加了色素的生成。
主要与外伤、妊娠、全身性疾病有关，不需要特别的处理。排除了诱发因素，就会逐渐的恢复到正常状态。
甲母痣、甲雀斑样痣、恶性黑色素瘤等都是黑色素细胞增殖所致。建议及时到医院皮肤科检查，确定病因后进行针对性的治疗。