治疗灰指甲的主要原理是通过腐蚀性的手段把整个灰指甲表面表皮腐蚀掉，可以抑制真菌的生长，并不能够治疗灰指甲。如果想要把这种灰指甲彻底治疗，一般可以选择连续口服三个月到半年的药片。
甲癣通常是由真菌感染引起的。因此，建议以抗真菌药物为主治疗甲癣。水杨酸不杀死真菌，因此不能用于治疗甲癣。水杨酸是其他药物的成分之一，具有解热镇痛作用，但无杀菌作用。
花椒按照中医的功能主治来说是有杀菌的作用，因此如果用花椒水来涂灰指甲，可能会有减缓的趋势，但是也并不是所有的人对药物敏感，用花椒和盐煮水.盐具有杀菌的作用，而花椒能够除湿，很好地收敛皮肤，这对治疗脚气很好.拿个小盆，先接些凉水，将煮开了的花椒盐水适量地加入盆中.好了，温度差不多不烫脚的时候就可以拿来泡脚了.像这样用煮过的花椒盐水泡脚，每天一次，坚持使用一周，一般的脚气都能被治好。
灰指甲完全可以治好，大部分都可以治好，假如长得轻，直接外用药就可以，长得重通过口服药也可以。另一个假如有的口服药效果不理想，有可能是根的末梢循环不好，也可以适当结合一下中药泡洗的，还有中药活血化瘀的药，活血通络的药给他口服就行，配合起来治，大部分都是可以治好的。
灰指甲属于真菌感染，主要是由于脚气或者手癣传染导致目前主要使用药物进行治疗，应该坚持治疗一个阶段局部的症状，消失后再巩固治疗1~2周的时间可以治好。另外平时也可以使用花椒水泡脚，也能够有效的预防和治疗真菌感染，还应该穿疏松透气的鞋子，这样有利于脚的健康。
