初期的肛门湿疹可酌情应用抗生素，或是水煎取汁坐浴。对糜烂渗出明显者，用外敷软膏治疗。不要吃生冷辛辣的食物。每天用温水坐浴一下，保持局部皮肤相对的清洁干燥。
肛周湿疹是指局限于肛门周围皮肤，少数可累及会阴部。奇痒难忍。常潮湿，皮肤浸润肥厚，可发生皲裂。任何年龄均可发病。湿疹的发病原因很复杂，有内在因素与外在因素的相互作用，常是多方面的。外在因素如生活环境、气候条件等均可影响湿疹的发生。
治疗全身慢性疾患，如消化不良、肠寄生虫病、糖尿病、精神神经异常、小腿静脉曲张等。避免食用一些刺激性食物，如葱、姜、蒜、浓茶、咖啡、酒类及其他容易引起湿疹的食物，如鱼、虾等海味。
主要是进行控制患者的症状，寻找湿疹的患病原因。治疗好转后仍易反复发作，难根治。湿疹病因复杂，且临床形态和部位各有特点，故用药因人而异。此外，需在专业医师指导下用药，切忌乱用药。
肛门湿疹可以使用清洗的药物坐浴，涂抹外用尿素药膏进行治疗。肛门湿疹是因为局部长期潮湿，受到摩擦等不良刺激造成的，恢复较慢，治疗后容易复发。要生活规律，适当参加体育锻炼，不要搔抓刺激肛门周围皮肤，清淡饮食，多吃蔬菜和水果。
这种病是可以自己好的。湿疹一般和过敏有关系，另外也可见于接触其他异常物质引起，可以出现皮肤瘙痒等症状，如果瘙痒严重可以使用外用药物治疗，另外可以服用抗过敏药物治疗，也可以到皮肤科检查一下，根据病情采取治疗，注意皮肤卫生，不要吃辛辣食物。