治疗甲癣可以使用外涂药，也可以内服药，还可以通过外科手术拔除病甲。外科手术拔甲适于单发的灰指甲，可在局部麻醉下进行，或先用溶甲剂把病甲包扎3天，然后再拔除。
可以选用局部用药，根据药剂不同，药物有浸泡、局部涂药和封包削治等使用方法。而在用药之前，患者应要使用指甲锉先将甲片削薄才可以。另外也可通过内服药物进行治疗。
甲癣是由皮癣菌侵犯甲板或甲下所引起的甲部疾病，而甲真菌病是由皮癣菌、非皮癣菌及酵母菌等真菌引起的甲感染。两者因治疗方法相同，灰指甲就是甲癣，因为指甲的变化有很多疾病可以引起，也可以发生一些颜色或者厚薄上的变化，甲癣就是真菌感染引起的灰指甲。
治疗甲癣可以选用各种抗真菌的外用药膏进行治疗较好，另外也可以采用激光治疗，激光具有高靶向性、高能量的特点，能使病甲局部接受较高密度的能量并能够对病原菌有一定的抑制作用。
甲癣的治疗主要分为两种，口服药和外用药。口服药主要是对于症状比较重的，有多个趾甲的受累或者是累及单个指甲，比如说拇趾的趾甲累及，而且要求必须是肝功能正常才可以口服药物治疗。
