3%至5%的碘酒是可以用于治疗灰指甲的。碘酒溶液可以抑制真菌的生成，并且起到消毒的作用，可以帮助缓解灰指甲的症状。平时要注意保持个人卫生，保持患处表面的干燥洁净，避免出现软组织的感染。
灰色指甲是真菌感染。如果用碘酒消毒，它们只能消失在表面，而不能消失到病变的深度。建议用抗真菌剂治疗灰色指甲。治疗方法包括手术、拔除指甲以及口服消炎类药物。同时，灰色指甲的感染力相对较强。建议家庭成员小心预防。
碘不能用来治疗甲癣，主要是碘不能穿透甲床，不能杀死真菌。为了治疗甲癣，要使用口服抗真菌药物。可以去当地的正规医院皮肤科看病。确诊为甲癣，可以使用其他抗真菌药物。
碘酒是消毒剂，是碘酊等成分，所以很常见，灰指甲既然是真菌感染，有一定疗效，碘酒是碘酊，碘加酒精叫碘酊，有一定作用，但作用一般不太强，也容易产生耐药性，当然碘同时可以产生局部过敏，很多人群对碘过敏，所以一般不主张用碘酒治疗，不规范。
碘酒对灰指甲没效果，灰指甲是真菌感染引起的，需要服用抗真菌药物，治疗期间不要熬夜，注意饮食合理，多吃富含维生素的食物，比如葡萄，苹果，胡萝卜，山药等。如果出现反酸现象，配合药物治疗。
碘酒不可以杀死灰指甲的真菌，碘酒只是起皮肤消毒作用，对真菌感染作用不大，是能起到抑制灰指甲的作用。但是更多的真菌潜藏在甲床下面，碘酒对其基本没有什么效果。