肛门疼痛是由血栓性外痔，肛裂，肛周脓肿，肛门神经痛引起的。
1、血栓性外痔，表现为肛缘隆起性肿物，疼痛，伴有水肿，肿物内可见紫黑色血栓。2、肛裂，表现为排便时肛门周期性疼痛，便血和便秘，检查时肛管可以呈梭形裂口。3、肛周脓肿，肛门周围疼痛，疼痛部位可触及肿块，并有红、肿、热、痛等急性炎症表现，肿块可有波动感，全身症状可伴有发热等症状。4、肛门神经痛，表现为不明原因的肛门疼痛，各项检查都是正常的。
建议到肛肠外科进行检查，在医生的指导下进行治疗。平常注意休息，多喝水，排便困难时不要使用大力，可以多喝水，促进胃肠消化。
痔疮的治疗首先要保持大便通畅，进食易消化，少含渣滓的食物。饮食应粗细搭配，少饮浓茶，咖啡，酒类及少进辛辣食物，以减少对肛管的刺激。便后要温水坐浴，冻治疗及物理治疗。严重者可手术治疗，包括结扎法，胶圈套扎法，痔切除等。建议上当地正规医院检查治疗。
大多是由肛裂引起的。主要原因是大便干燥，刺激肛门，陈旧裂口扩张所致。如果排便时突然疼起来，肛门边缘的一侧出现了紫黑色圆形肿块，质地较硬，水肿严重的肿块发亮，并伴有持续性疼痛，则可能是炎性血栓性外痔。
小腹与肛门疼痛考虑应该是慢性溃疡性直肠炎，这是一种发生在直肠的炎症。肠炎可为充血性、水肿性、糜烂性、溃疡性或溃疡性;它会引起疼痛和出血。肛门内总是有大便，大便滴漏，大便不干净，大便次数较多，体重较轻，并可引起直肠脓和粘液。
肛门疼痛有出血的现象，考虑是发生于齿状线下方的疾病，具体的包括肛裂，血栓性外痔，肛瘘。尤其是在便秘之后，会诱发急性血栓性外痔的出现，并且有明显的肛门疼痛，排便带血，查体也会发现肛门口有痔核形成，充血水肿，而肛裂主要是发生于肛门的后正中处，并且反复的发作，会形成肛裂的溃疡面，排便的时候导致症状的加重而出血和疼痛。