治疗尖锐湿疣主要采用中西药配合治疗。另外采用局部和全身口服治疗，局部治疗可以使用激光，冷冻甚至外科手术治疗。在治疗结束后应该注意饮食，避免辛辣鱼腥等刺激性食物，另外应该戒除烟酒。同时应该养成健康的性生活习惯避免与其他异性朋友进行性接触。
病症比较轻的可以使用鸡眼膏贴敷，鸡眼膏可以使角质腐蚀软化，在短时间内可以使鸡眼脱落，但这种治疗方式的复发率比较高。如果病症比较严重或者想要彻底的清除，到正规医院皮肤科采用激光治疗，在治疗期间内需要注意保持创面的清洁和干燥，在一周之内尽量不要沾到水，以免发生二次感染。在痊愈之后也要注意养护，勤洗鞋袜，穿宽松舒适的鞋子，防止跖疣复发。
为了治疗鸡眼，应该穿合适的鞋子和靴子，以避免局部压迫。玉米的治疗可以在家进行。该方法包括以下步骤：将患足用热水浸泡，待鸡眼变软后用消毒刀片剥去角质，用胶带粘贴正常皮肤(中间开一个小孔)，露出鸡眼，外用鸡眼药膏，直至角质栓完全腐蚀损伤；也可以用外科方法挖出，但是当继发于感染时，外科手术就不能进行了。
足底疣通常用激光烧灼治疗。治疗后，属于皮肤烧伤，可引起局部疼痛。可以依据皮肤烧伤来治疗。每天使用碘伏消毒，然后每天使用换药2-3次。为了防止感染，还需要口服抗菌药物来防止感染。在恢复期间，需要尽量减少活动，加强营养。
肛周湿疣的治疗常用的有激光、冷冻、光动力等先将疣体清除干净，后期配合药物治疗，另外饮食多注意，忌酒，忌食辛辣刺激等食物。如果没有不洁的性行为，就可能是痔疮。如果是痔疮肿物脱出也会有一个东西在肛门了。