治疗扁平疣的物理治疗包括冷冻、电灼、刮除和激光等，适用于皮损数目较少者。内用药物治疗，目前尚无确切有效的抗人类乳头瘤病毒治疗药物，可试用免疫调节剂；中药以清热解毒，散风平肝，散结为治则，有时可获得较好的疗效。
治疗扁平疣的方法可以采用内外合治法。外治的方法通常包括冷冻治疗、激光治疗、药物治疗、火针治疗等。外治药物大多具有腐蚀性，使用不当反而容易留下色素沉着，所以使用时应慎重。
治疗扁平疣主要是免疫调节类药物，可以防止复发，平常还要多锻炼身体增强免疫力，还可以配合外用药物进行治疗，同时也可以用抗病毒药物，要遵医嘱使用药物。注意观察，适当运动增强抵抗力。
一般情况下，扁平疣是一种人乳头瘤病毒感染导致的皮肤病。具体内容如下：
不注意个人卫生、病毒感染等原因可能导致患者出现扁平疣，这是一种人乳头瘤病毒感染导致的皮肤病，患者可以及时前往正规医院，在医生指导下使用维A酸乳膏、重组人a-2b干扰素乳膏等药物进行治疗，如果情况严重，还可以前往正规医院，通过液氮冷冻、激光烧灼来治疗。
扁平疣是由人乳头状瘤病毒（HPV）感染引起的，好发于青少年的病毒感染性疾病。可突然起病，皮损多发于面部、手背、手臂，临床表现为皮色或粉红色的扁平丘疹，无明显的自觉症状，部分患者自觉轻微瘙痒。病程慢性，可通过直接或间接的接触传染。
