一般情况下，如果孩子的脚底有水疱，可以采取相应的方法来进行处理，如果是手足口病引起的，这种情况是因为病毒引起的，可以服用盐酸伐昔洛韦冲剂，然后再用阿昔洛软膏等药物进行抗菌处理。如果是全身性湿疹引起的，在足底和周身都会有大量的小水疱、丘疹，还可能出现糜烂、渗出等情况，这时候可以用复方黄柏液涂抹，可以外用克林霉素磷脂凝胶，有较好的治疗效果，建议在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。
足癣是脚部和脚趾之间的浅层皮肤真菌感染，如果有水泡，就是水泡型的足癣问题。对于这类足癣，可用复方间笨二酚搽剂、复方土槿皮擦剂、2%水杨酸软膏等具有较强的刺激性和剥落作用。还可以口服特比奈芬乳膏，阿莫罗芬软膏，也可以用来治疗。足癣的治疗需要一个足疗程，通常是持续6-8个星期，或在症状消失后继续服用2个星期。
脚底长水泡使用消毒针将水疱挑破，消毒即可。如果有化脓表现，需要口服抗生素，如果是湿疹皮肤病进一步发展而形成的水疱，外涂激素类的药膏，如果脚底起了水泡，是汗疱疹引起的，在平时的饮食上，不要吃一些辛辣刺激的食物。保持脚底的干净和清洁，每天晚上用热水泡脚。
脚底总是长小水泡考虑是因为局部没有注意清洁好，导致的一些真菌感染，也可能是穿鞋摩擦以后产生的，治疗上也可以外用一些抗真菌的药膏，平时可以穿比较透气的鞋子。同时每天要注意好清洁。
可以先使用药物治疗，看是否可以好转恢复，也可以到皮肤科就诊检查，根据病情采取药物治疗。注意皮肤卫生，注意鞋袜的卫生，不要吃辛辣的食物。如果是真菌感染引起，可以使用抗真菌药物治疗。
脚底长水泡痒多数情况是临床常见的足癣,水疱型脚气或者足癣,可以外用抗真菌药膏,如盐酸特比萘芬乳膏、环吡酮胺乳膏、硝酸舍他康唑软膏或硝酸咪康唑乳膏,都可以用来外用缓解瘙痒,去除水泡,外用药膏大概2-3天之后就能够见效。同时外用卤米松软膏、或者是丁酸氢化可的松软膏1天2次涂抹治疗。平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。