可能是过性的损伤甲床，从而形成指甲的不平。另外如是缺乏微量元素，缺乏必要的营养物质尤其是蛋白质，严重消耗性的疾病，如严重的肝病、糖尿病等，也可以导致指甲凹凸不平。
大拇指指甲凹凸不平，可能是多方面的因素导致。最常见的可能是局部的外伤而形成的甲母质功能障碍，最终形成甲板的凹凸不平。也有可能是慢性湿疹，或者是银屑病以及其他的皮肤病继发形成的指甲凹凸不平。当然也有可能是甲真菌病而造成的指甲的损害，最终形成甲板的变形。另外，也有可能是微量元素的缺乏导致甲板形态异常。
一般情况下，大拇指甲盖凹凸不平可能是缺钙、甲癣等因素造成的，具体内容如下：
1.缺钙：如果患者存在营养不足的情况，体内可能会缺钙，可能会对指甲的生长造成一定的影响，可能出现大拇指甲盖凹凸不平的情况。患者可以遵医嘱使用葡萄糖酸钙口服溶液等药物进行治疗。
2.甲癣：真菌感染可能诱发甲癣，可能导致患者大拇指甲盖凹凸不平，还可能变脆、发黄。患者应及时就诊，遵医嘱使用盐酸特比萘芬软膏等进行治疗，以免病情进一步发展。
大拇指的指甲出现这种改变，多和甲床功能异常有关，也有真菌感染的可能，缺铁缺钙所致的指甲异常，多会包括所有的指甲的，可以到皮肤科检查看看，如果是真菌感染可以用药物治疗。
可会有多种原因导致指甲发育异常，比如挤压、受凉、末梢血液循环障碍以及真菌感染等，也考虑为缺乏微量元素引起的，可做微量元素检查，要注意饮食搭配避免偏食多吃新鲜的蔬菜水果，避免熬夜。
大拇指指甲上凹凸不平要考虑最近是不是有一些经常用手的重体力劳动，造成指甲损伤，近期饮食习惯的不良，维生素缺乏，以及熬夜劳累都会导致体内营养缺乏，而造成指甲凹凸不平。