一般情况下，龟头冠沟有小疙瘩、疼可能是珍珠状丘疹、尖锐湿疣等原因引起的。具体内容如下：
1.珍珠状丘疹：珍珠状丘疹是以阴茎冠状边缘和冠状沟出现珍珠状、半透明丘疹为特征的皮肤病，多与包皮过长、卫生不良等因素有关，可能会导致患者龟头冠沟有小疙瘩、疼。
2.尖锐湿疣：尖锐湿疣一般是由人乳头瘤病毒感染引起的常见性传播疾病，常表现为生殖器及周围皮肤上出现丘疹、斑块等症状，可能会导致患者龟头冠沟有小疙瘩、疼。
龟头瘙痒红肿，并且有疙瘩，常见的原因是龟头的炎症引起的。对于龟头炎症的治疗，主要是针对引起龟头炎症的致病菌，针对性的应用抗菌素治疗。同时要注意保持生殖器的清洁卫生，治疗期间禁止性生活。
多因珍珠疹引起的。该病是人体的一种生理性发育变异，多见于包皮过长的和有手淫习惯的青年人。通常为一些珍珠状、红色、黄色或白色半透明丘疹，沿排列成一行至数行，有时包绕整个冠状沟。因该病无传染性及不碍于健康，故不需要处理。
认为是由炎症和其他疾病引起的。不排除龟头炎很可能是由。只有通过检查才能做出诊断。尽早去正规医院的男性科检查，看看是哪种疾病引起的，然后进行有针对性的治疗。平时，注意外生殖器的卫生，经常更换和清洗内裤，清洗后暴露在阳光下，禁止吃辛辣刺激的食物，禁止吸烟和饮酒，暂时不共用房间，注意休息。
一般情况下，龟头有疙瘩可能是以下三种原因造成的：
1.尖锐湿疣是一种性病，其外表呈菜花状或分叶状，偶尔会出现发痒的情况。
2.有不注重日常清洁的的患者，可以考虑出现有瘙痒的龟头湿疹，可以服用消炎药物，用碘伏杀菌。
3.如果是单纯的疱疹，可以看到一个小的肿块，上面有一个小脓点，需要怀疑是不是病毒感染造成的，如果是一般的病毒感染，很好治疗。注意保持个人卫生。
一般情况下，龟头周围有小疙瘩，可能是慢性龟头炎症所致珍珠状丘疹，此症与包皮过长、包茎有关。患者可以在医生指导下使用夫西地酸软膏、地塞米松软膏等药物进行治疗，对症处理2周，此类小疙瘩可缓慢消退。龟头周围有小疙瘩也可能为病毒感染引起的尖锐湿疣，患者需到正规医院，在医生正指导下，根据实际情况通过激光、冷冻、电灼等方法进行治疗，治疗护需要再涂干扰素凝胶彻底清除残余病毒，防止复发。