导致灰指甲的原因比较多，一般常见于患有手癣，足癣，也就是手足有真菌感染时，长期得不到有效的治疗，则可以传染至指甲，导致指甲的受累而引起灰指甲。另外，假如人体自身免疫功能较差时，或者患有糖尿病等易感染的人群时，则容易感染真菌而导致灰指甲的发病。此外周围环境，卫生条件比较差的情况下也容易导致灰指甲的发病。
个人原因：与个人卫生习惯有关系。如经常光顾卫生条件差的公共泳池浴室、使用公共拖鞋、长期穿不透气的鞋袜、女性长期穿高跟鞋、男性穿尖头皮鞋、美甲导致指甲受损导致感染；环境原因：气温高、湿度大也是多发灰指甲的原因之一。因此，夏季比冬季、旱季多且重。有些耐旱抗寒的真菌，在寒冷、干旱季节照样致病，这在我国北方多见。
根据目前的情况，甲真菌病是有问题的。大部分与接触脏水、长期指甲摩擦、湿度过大和指甲潮湿有关。如果灰指甲的问题需要治疗，建议及时考虑一些抗真菌药物。为了预防发生，建议保持指甲干燥干净，并剪短指甲。
如果脚气没有被有效治疗，是可能会引起灰指甲的。
脚气是因真菌感染导致的，患者可出现足部浸渍、脱皮等症状。如果脚气患者未能及时治疗，可能会使足部真菌逐渐感染至指（趾）甲，使甲下发生真菌感染，出现指（趾）甲变色、变形等灰指甲症状。建议患者及时治疗脚气，可通过灰黄霉素片、盐酸特比萘芬片等药物来改善脚气。如果出现了灰指甲的情况，患者可选用亮甲牌复方聚维酮碘搽剂进行治疗，能够起到深入杀菌的功效，有效减轻灰指甲症状。
甲癣主要由真菌感染引起，表现为指甲增厚、发黄、脆化和脱落等不同症状。它通常伴有脚气，没有明显的疼痛或瘙痒等症状。脚麻木和甲癣是不相关的。有必要排除周围神经炎、椎间盘突出和颈椎病的可能性。它可以在医院看到，并应在澄清后及时治疗。
脚气是由于真菌感染所引起的，如果不积极治疗，有可能引起灰指甲的，建议尽快采取药物治疗，要多注意脚的干净和卫生，勤换鞋，勤洗脚。不要跟别人混穿鞋子，或者共用洗脚盆等。