新生儿感染生殖器疱疹在皮肤、咽、眼结合膜等处出现疱疹全身性弥散型表现为黄疸、肝炎、肺炎等全身毒血症症状。处理不当的新生儿疱疹病毒感染有百分之七十的死亡率或神经系统后遗症中枢神经型表现为颅内压增高、抽搐等颅内感染的症状。
新生儿感染生殖器疱疹的症状是出现红斑，随着病情发展出现水泡，继而水泡破裂形成浅糜烂或者是溃疡。也有部分免疫力低下的婴儿还会出现前驱症状，在疱疹出现的前1-2天，局部就会出现刺痛、烧灼或者瘙痒等症状。生殖器疱疹可反复发作，对婴儿的健康和精神影响较大。
一般新生儿生殖器疱疹的症状表现比较明显，多由于感染了炎症引起的，会有局部长小疙瘩、起红疹，还有黄疸的出现，出现肺炎、肝炎等全身毒血症症状，必须及时到正规的儿童医院进行检查治疗，早点解决疾病烦恼。
生殖器疱疹初期症状是有局部的小红点，逐渐发展为三个到十个的小水泡以后逐渐浑浊，破溃自身感染的状态，要注意的就是生殖器疱疹的传染性非常强，由于发生的位置在皮肤位置，所以近期不要有性生活。
生殖器疱疹是在生殖器部位起的疱疹，所以，生殖器疱疹的症状一般是在生殖器的部位，一般在皮肤和黏膜的交界处出现的红斑，这些红斑经过一段时间就会变成水泡，由于这个水泡的泡壁比较薄，水泡泡壁会破裂，会形成浅的糜烂，有些人可以形成溃疡。
生殖器疱疹的早期可能会出现局部疼痛、瘙痒或者是针刺烧灼感，但是往往并不会持续很长时间，皮肤上会随即比较快的出现小水疱，呈簇状存在，出现水疱以后往往会在两天左右出现破溃，在水疱出现以后，会伴有剧烈的疼痛感。