有可能是由于治疗不当导致的疣体没有掉，或者是出现复发的情况。可以选择再次治疗，可以用激光、冷冻等物理的办法将其祛除，或者外涂药物，也可以配合增强免疫力的药物口服。
一般情况下，扁平疣变黑可能是色素沉着造成的，具体内容如下：
病毒感染可能会导致患者患有扁平疣，如果患者长扁平疣的部位长期被摩擦，可能会出现色素沉着的情况，导致扁平疣变黑。如果患者扁平疣疣体较小，可以通过外用干扰素类药物、饮食调理、适当运动等方式进行保守治疗。如果长期药物治疗的效果不明显，患者应及时尽快就诊，可以通过激光、冷冻等方式进行治疗，以去除疣体，避免病情进一步发展。
扁平疣是由人类乳头瘤病毒感染皮肤粘膜，而引起的一种良性赘生物，主要通过皮肤粘膜微小破损处，进入上皮细胞内复制、增殖，导致上皮细胞异常分化和增生，引起上皮良性赘生物。
如果是新发的扁平疣出现瘙痒，说明扁平疣处于发展期，传染性比较强，数量可能会增多，要注意平时不能搔抓、摩擦扁平疣，防止自身接种反应。如果是时间久的扁平疣，平时没有什么感觉，突然间出现瘙痒，有可能是体内免疫力抵抗病毒，说明扁平疣可能会逐渐消退。
身上长了好多扁平疣是人乳头瘤病毒感染引起的常见皮肤病，与自身免疫力低下有关系，有传染性会越长越多。具体要到医院皮肤科检查确诊一下，如果是扁平疣可以口服转移因子，肌肉注射干扰素，局部外用维a酸乳膏，或者冷冻、激光治疗等方法去除。
身上长扁平疣的情况是很常见的。扁平疣是一种病毒性良性皮肤赘生物，是由人乳头瘤病毒感染而引起的皮肤病。本病发病除了病毒感染以外，也跟自身免疫力有很大的关系，大多都有免疫力低下的情况。扁平疣是一种由自限性的皮肤病，有时是可以自愈的。扁平疣治疗的方法也比较多，可以使用激光，冷冻或者电离子等方法，也可以使用药物治疗。