灰指甲可以用外用药物治疗，可采用消炎除菌的药物；可以同时配合抗生素治疗；灰指甲治疗的疗程比较长，要坚持治疗。定期复查观察灰指甲恢复情况，个人用品单独使用，以免导致交叉感染。
脚趾上长灰指甲，这是一种真菌感染性的疾病，治疗就针对病原体来用药，在医生的指导下外用抗真菌的制剂，也可服用口服的药物治疗，到医院先进行手术拔除患甲，然后再在医生的指导下用抗真菌药等对症治疗。
脚上有灰指甲可以用以下方法治疗：用小利刀刮除松脆病甲，或挫薄增厚的病甲，然后涂碘酒或冰醋酸溶液，也可把病甲浸于碘酒或鹅掌风特效药中，坚持治疗几个月后，即可生出新甲。治疗严重的灰指甲，还要内服灰黄霉素几个月。
想治好脚部灰指甲就必须给脚创造一个无菌的环境，并杀灭体内真菌，只有这样才能长出健康的新甲。脚指甲质地坚硬，普通外用药很难穿透甲板，在治疗时应尽量祛除病甲，可采用泡脚修甲、诊室拨甲或使用穿透性较强的外用药。
灰指甲可以通过多种方法来治疗，灰指甲是由于真菌感染累及到甲板或甲床而出现的疾病，首先需要进行规范的抗真菌治疗，在应用这些药物之前，往往都要把自己的病甲削薄，保证药物发挥不错的疗效，较严重的时候需要同时配合口服的抗真菌药物协同治疗。