甲真菌病的治疗主要使用抗真菌药物，因为甲真菌病的病原菌是真菌。抗真菌制剂可以在医生的指导下外用，抗生素也可以在短时间内服用。患者可以在外用抗菌药物前用温开水浸泡患病指甲约半小时，然后在用药前用刀刮干净。建议把病甲拨掉，然后再用药治疗，这样容易治好。平时应当去正规的三甲医院进行检查，平时多吃一些蔬菜水果，增强自身的体质。
灰指甲是真菌感染而导致的，多表现为指甲变脆，有白斑，有增厚，有指甲变形，有颜色改变等表现，需要及时去皮肤科进一步的检查一下真菌，在医生指导下根据症状及时的对症治疗定时复查。
外用药物可以有一定的疗效，但疗程长，要有长期坚持治疗的耐心，手指甲有灰指甲一般外用药物最少三个月。想治好灰指甲可以采用外用加内服的办法，用药一周休息三周为一个疗程。一般需要3个疗程。用药期间密切监测肝功能。
去除黑指甲的方法主要是运用药物治疗或者手术治疗，药物治疗见效比较慢，治疗效果不稳定。手术治疗需要拔除指甲有一定的痛苦，外用疗法较安全，一般无痛苦、无副作用，是治疗灰指甲的首选疗法。
灰指甲会影响到皮肤的美观，会限制日常的工作，会导致真菌的传染。一些患上灰指甲的患者，会导致自己的手部或者是脚部的指甲颜色的改变，还有的灰指甲的患者会引起指甲的变形，人类所从事的穿针引线、书写、做饭、打字、编织、弹奏等工作，都离不开指甲的协助。一旦患上灰指甲，这类工作将受到干扰。指甲生长在手的末端有保护作用，一旦患病，手将很容易因碰撞而受伤。很多的灰指甲的出现，往往就是由于人们的平时不注意自己指甲的卫生引起，从而会感染到一些皮肤的真菌，而如果感染后不及时的处理，就会导致真菌的传染的。建议灰指甲患者一定要做好卫生的清洁，不和家人共用盆，毛巾，鞋袜，指甲刀等生活用品。
灰指甲实际上是甲癣，治疗甲癣的方法有外用药和口服药两种方法。外治法上首先是选用各种抗真菌之类的外用药膏，内治法可口服抗真菌之类的药物，但是这类药物副作用较大，要经过判定是否能够选用，而且在治疗过程中还需要监测可能发生的副作用。
