男性生殖器疱疹治疗主要是针对如何的有效去除病毒，目前临床上最先进的疱疹的方法是艾拉光基因免疫种植疗法，病人配合，不进行不洁的性行为、饮食、休息，生殖器疱疹是一种复发率高、传染性强、临床难治好的性传播疾病，多发生于性关系混乱的男女，如果不及时治疗会影响到以后的生育。
男性生殖器疱疹的症状可以保持局部卫生，做好消毒，可以口服抗病毒的药物治疗，外用对症的药物涂抹，内衣做好消毒，不要搔抓，以免感染，在治疗期间不要同房，平时做好预防，在治疗期间不要吃有刺激性的食物，增强体质，必要时可以口服抗炎的药物来进行治疗。日常饮食注意以清淡和易消化的食品为主，禁食辛辣刺激的食品。
男性生殖器疱疹治疗1个月-2个月会好。生殖器疱疹是我国常见性传播疾病之一，由单纯疱疹病毒感染所引起。平时要避免不洁性交及不正当的性关系，活动性生殖器疱疹病人绝对禁止与任何人发生性关系。
男性生殖器疱疹的病人所表现出来的症状比女性生殖器疱疹的病人明显。多数是在感染病菌后两天到十天以内，就会出现难以忍受的不舒服的症状。男性生殖器疱疹的症状多数发生在龟头、尿道口、冠状沟、阴茎、阴囊等部位，先有灼热感，然后产生群丘疹，有些是一簇，有些是多簇，然后慢慢的形成水疱。时候如果不及时地治疗，几天之后就会转变成脓疱，破了后形成糜烂患者溃疡。感觉疼痛，两到三周后结痂。
男性生殖器疱疹能不能治根，目前还在研究过程中。抗病毒治疗不能完全杀灭这种病毒，它会隐藏在骶神经节内，一旦身体的免疫力降低以后，潜伏的病毒会伺机而动，直接侵袭到外生殖器皮肤和黏膜，从而导致生殖器疱疹的再次发作。如果想要降低发病几率，需要提高自身的免疫力。在治疗方面，在正规治疗的同时，也可以用提高免疫力的药物。
男性生殖器疱疹病病补充日常营养即可。男性生殖器疱疹主要由单纯疱疹病毒感染引起泌尿生殖器及皮肤黏膜的一种炎性反应，对于反复发作的，可以加用一些中药治疗，可以预防它的反复发作，加速它的病情恢复。没有症状或者临床感染者无需药物治疗。其次，更重要的应该积极预防，避免它的反复发作，避免不洁的性接触史，发作的时候，保持局部的清洁，预防它的继发感染，还有避免引起诱发的一些因素，如过度劳累、饮酒等。