手指甲上有小坑多考虑有真菌感染，继续发展下去，指甲会出现灰指甲等真菌性甲藓。可以外用药，有脚气的话，早点治疗脚气，避免用手指甲接触有脚气的脚。避免吃辛辣油腻刺激性食物，不要吃海鲜和牛羊肉。
手指甲有针眼状小坑可能与缺乏维生素、甲癣等原因有关，建议对症治疗。具体分析如下：
1.缺乏维生素：如果手指甲缺乏维生素，甲床营养不良，可能会出现针眼状小坑，同时还可能伴有指甲变厚、甲床分离等情况。建议平时可以多吃鱼、虾、牛奶、胡萝卜等食物来改善症状。
2.甲癣：甲癣是皮肤癣菌侵犯甲板及甲下而引起的疾病，一般表现为甲增厚、甲质松碎、刺激性小坑等。建议患者可以通过激光治疗使用激光照射在局部，通常对病原菌有一定的抑制作用，能够改善症状。
指甲上有凹陷的小坑称为甲凹点，长期存在的指甲凹点一般多见于银屑病，扁平苔藓和慢性湿疹，以及斑秃皮炎，指甲真菌感染都容易引起这样的症状。如果没有这些伴随疾病，有些长期美甲的人也可能出现。
新生儿头部有两个无骨的骨窗，这是医学上的叫法。宝宝的脑袋上有一个小洞，通常是前囟门，囟门的表面是头皮，后面是脑膜，然后是大脑和脑脊液，用手指轻轻触碰囟门，就能感觉到跳动，这是脑积液随着心脏的波动、血压的变化而变化的，它的节奏与脉搏是一样的，家长会误以为是头部有一个小坑，这是正常的。囟门在1年半左右还没有完全闭上，可能是因为营养不良或者是血钙过少。
如果手指甲有横向凹陷，可能是因为缺钙的原因，一定要及时的进行补钙，平时的时候也要多做一些户外的运动，因为多晒太阳也是具有补钙的作用，在自己的饮食上也可以选择一些牛奶来进行补钙，因为一般正常的手指甲的颜色都是比较红润，而且是平整的。
平时饮食不均衡或者营养不良引起缺锌一系列的表现，平时均衡饮食，不要挑食，增加营养多吃鱼虾牛奶，海带等食品同时服用保健品比如葡萄糖酸锌，规律生活，注意休息，避免疲劳就可以了。