灰指甲的病因都是真菌的微生物感染引起的。其中最主要的是皮肤癣菌，这种菌就生存在我们身边，如土壤里、浴池及游泳池的地面、动物（见于猫、狗、猪等）身上，以及患有皮肤真菌病的皮疹内。到专业的医院进行治疗。
小孩子也有可能会导致有灰指甲的，灰指甲有可能会导致指甲出现凹凸不平，这个疾病是有传染性的，主要有可能是由于共用指甲刀或者是触碰了一些污水，由真菌感染而引起，另外，孩子平时都比较顽皮，对很多事物都充满好奇，并且很多孩子都不注意卫生，也不会经常洗手，在玩得过程中会携带很多的病菌，因为指甲可以说是儿童的身体最脏区域之一，这样孩子就很容易感染病菌。
灰指甲又称为甲癣，由皮肤癣菌、酵母菌及真菌引起的甲板和甲下组织的真菌感染。皮肤癣菌最为多见是因为皮肤癣菌有角蛋白酶，对含丰富的角质蛋白的甲板更具侵袭力；酵母和真菌也可单独导致甲的感染，但多继发于甲的水化或外伤，或者与皮肤癣菌共同造成混合感染。甲板由于缺少血循环，无法产生针对侵入真菌的免疫反应，故甲真菌病一旦形成，很难治好。
灰指甲是真菌微生物感染引起的。甲癣病变始于甲远端、侧缘或甲褶部，表现为甲颜色和形态异常。一般以1到2个指甲开始发病，重者全部指甲均可累及。患病甲板失去光泽，日久甲板变脆而破损脱落。多呈灰白色，且失去光泽。
会出现甲板表面粗糙，凹凸不平，失去光泽。这种凹凸不平既可以为纵向，也可以为横向。呈现出污灰色，褐色，白色，黄色，黑色等，被破坏的甲板缺乏弹性和韧性而变脆，角质颗粒呈粉末状易于脱落、松散而变得碎杂。