肛门疣严重可以结扎疗法，对单个疣赘，其基底较小也可用结扎疗法，数日后疣赘可自行脱落，然后外用药膏，促使伤口长合。还可以推疣法，适用于明显高出皮面，疣赘小，数量少的病人。方法。
肛门里面的尖锐湿疣治疗可以选择手术，冷冻或者是激光以及微波手术都可以去除肛门里面的尖锐湿疣。要想彻底摆脱尖锐湿疣的困扰，一定要选择科学有效的新疗法，不要另辟蹊径，只有科学有效的治疗方法，才能有效治疗尖锐湿疣。
肛门疣做个激光手术就可以了。手术以后一定要多注意休息，平时一定要多注意卫生，大便完要及时清洗一下会比较好。尽量不要吃辛辣食物，刺激性食物，海鲜之类的，多喝点温开水，多吃点新鲜青菜水果，多注意休息。
有些疣是比较棘手的，需要药物甚至于手术治疗。处理不一样的，有些黏膜小丘疹不一定是疣，是支原体，就像普通沙眼里面的小颗粒类似．疣偏黑，支原体色正常皮肤，如果要明确判断还是要放心医院的检查，还有就是用些抗病毒药物治疗，后来判断治疗上中西医结合比较好。
想检查肛管到肛肠专科做个肛门镜和肛门指检就可以了，肛门尖锐湿疣患病初起呈绒毛状，散在小乳头，在黏膜多为湿性湿疣，在外面多为干性湿疣。湿性疣呈淡粉红色，而干性疣则呈褐色或灰色。其生长较快，成倍增体增长，可生长为成簇的花瓣状疣体，其根部多细而孤立。可有瘙痒或稍微疼痛，阴道或肛门部有分泌物增加，略有臭味。